RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 OIT3Q8WWZ8 545 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 TREM2Q9NZC2 230 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 MID2Q9UJV3 735 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 FAM153BP0C7A2 387 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 PAX7P23759 505 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 KHKP50053 298 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 BNIP2Q12982 314 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 DAG1Q14118 895 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 ELFN2Q5R3F8 820 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 CREB3L2Q70SY1 520 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 TUBGCP3Q96CW5 907 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 FAHD2AQ96GK7 314 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 MECRQ9BV79 373 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 NOX3Q9HBY0 568 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 CRLF2Q9HC73 371 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 LOC105371242A0A075B767 164 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 SEC14L2O76054 403 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 C1QCP02747 245 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 SHBGP04278 402 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 GUSBP08236 651 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 GAAP10253 952 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 CBR1P16152 277 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 KRT4P19013 534 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 CXCR1P25024 350 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 ALDH3A1P30838 453 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 CAPZA2P47755 286 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 P2RY4P51582 365 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 ARF1P84077 181 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 MSMPQ1L6U9 139 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 AP1ARQ63HQ0 302 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 OR51F2Q8NH61 342 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 TAPBPLQ9BX59 468 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 CMAHPQ9Y471 501 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 CFAP73A6NFT4 308 aa15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 M0R233 179 aa15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 NPHS1O60500 1241 aa15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 TFP02787 698 aa15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 HPXP02790 462 aa15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 UQCRC2P22695 453 aa15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 COL8A2P25067 703 aa15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 CLDN8P56748 225 aa15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 EPS8Q12929 822 aa15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 SYPL1Q16563 259 aa15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 SAXO2Q658L1 398 aa15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 MDP1Q86V88 176 aa15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 EPHX4Q8IUS5 362 aa15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 FAM169BQ8N8A8 192 aa15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 ANKFN1Q8N957 763 aa15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 PIF1Q9H611 641 aa15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 REV1Q9UBZ9 1251 aa15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 TGP01266 2768 aa15.08■□□□□ 0.01
CCDC40-211ENST00000574099 TMPRSS2O15393 492 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 FRS3O43559 492 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 PNPP00491 289 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 AVPP01185 164 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 CHRM4P08173 479 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 GKN3PP0CG01 181 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 UQCRBP14927 111 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 ALDH3B1P43353 468 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 MAP2K6P52564 334 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 ARFIP2P53365 341 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 CLDN17P56750 224 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 PRR31Q5SQ13 230 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 USP43Q70EL4 1123 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 CMIPQ8IY22 773 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 CNPY4Q8N129 248 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 KDM8Q8N371 416 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 CADM2Q8N3J6 435 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 YIPF5Q969M3 257 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 JMJD8Q96S16 334 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 SLC6A7Q99884 636 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 SYT3Q9BQG1 590 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 TXLNGYQ9BZA5 131 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 RACGAP1Q9H0H5 632 aa15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 SLC38A1Q9H2H9 487 aa15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms