RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 CSNK2BP67870 215 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 FOXO1Q12778 655 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 OR7A5Q15622 319 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 NEDD8Q15843 81 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 SLC25A30Q5SVS4 291 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 ANKK1Q8NFD2 765 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 OTULINQ96BN8 352 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 OR5H15A6NDH6 313 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 M0R082 166 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 RGS10O43665 173 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 HIST1H2ABP04908 130 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 DBTP11182 482 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 ADH6P28332 368 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 SFTPDP35247 375 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 RFC3P40938 356 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 RPL5P46777 297 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 SELENBP1Q13228 472 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 MFAP5Q13361 173 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 PLBD1Q6P4A8 553 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 CPOQ8IVL8 374 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 MDS2Q8NDY4 140 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 FDCSPQ8NFU4 85 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 OR5J2Q8NH18 312 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 ZNF417Q8TAU3 575 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 HIST1H2ACQ93077 130 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 RASD2Q96D21 266 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 SIGLEC11Q96RL6 698 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 HCAR1Q9BXC0 346 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 NRIP3Q9NQ35 241 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 SERINC1Q9NRX5 453 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 TAS2R5Q9NYW4 299 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 A0A1W2PNR3 127 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 OR2M5A3KFT3 312 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 C11orf98E9PRG8 122 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 STSP08842 583 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 IDUAP35475 653 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 SLC15A1P46059 708 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 MYBPHQ13203 477 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 TMEM44Q2T9K0 475 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 AADACL4Q5VUY2 407 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 MEDAGQ5VYS4 303 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 XAF1Q6GPH4 301 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 CYB561A3Q8NBI2 242 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 ZNF248Q8NDW4 579 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 SDR9C7Q8NEX9 313 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 OR2M7Q8NG81 312 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 TMIGD2Q96BF3 282 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 SNX5Q9Y5X3 404 aa15.94■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 FREM3P0C091 2139 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 RIIAD1A6NNX1 92 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 PRODHO43272 600 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 OR2T1O43869 369 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 SERPINI2O75830 405 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 FADS2O95864 444 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 SRD5A2P31213 254 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 MAP2K4P45985 399 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 ALDH3B2P48448 385 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 CTXN1P60606 82 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 CRMP1Q14194 572 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 SGCBQ16585 318 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 SULF2Q8IWU5 870 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 OR52E2Q8NGJ4 325 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 OR4K13Q8NH42 304 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 FAM173AQ9BQD7 235 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 ZFP64Q9NPA5 681 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 SPTBN4Q9H254 2564 aa15.93■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 APOL3O95236 402 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 CDK1P06493 297 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 ADORA3P0DMS8 318 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 ZNF3P17036 446 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 PCMT1P22061 227 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 CDH11P55287 796 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 ARG2P78540 354 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 ST3GAL4Q11206 333 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 ANKDD1AQ495B1 522 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 PRSS48Q7RTY5 328 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 GHDCQ8N2G8 530 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 MFSD8Q8NHS3 518 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 Q96M85 177 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 ASPNQ9BXN1 380 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 POTEKPQ9BYX7 375 aa15.92■□□□□ 0.14
HERC2-208ENST00000566635 TAS2R16Q9NYV7 291 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms