RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557143.1

KLC1-222, Transcript of kinesin light chain 1, human

TSL 2

Gene KLC1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KLC1-222	ENST00000557143	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	MED4	Q9NPJ6	270 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	DPRX	A6NFQ7	191 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	AQP7P3	A6NL99	342 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	RAF1	P04049	648 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	GPI	P06744	558 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	IL32	P24001	234 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	DNASE1	P24855	282 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	CDH12	P55289	794 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	FAP	Q12884	760 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	KEAP1	Q14145	624 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	STK11	Q15831	433 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	CASP12	Q6UXS9	341 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	LINGO2	Q7L985	606 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	GPAT4	Q86UL3	456 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	KRT73	Q86Y46	540 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	PIGX	Q8TBF5	258 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	APH1A	Q96BI3	265 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	RCN3	Q96D15	328 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	ZNF583	Q96ND8	569 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	ZNF607	Q96SK3	696 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	ARHGDIG	Q99819	225 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	ITPR3	Q14573	2671 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	DNPH1	O43598	174 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	RAD51D	O75771	328 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	LGI1	O95970	557 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	HPR	P00739	348 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	ITGA5	P08648	1049 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	PNMT	P11086	282 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	COX5A	P20674	150 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	FUT4	P22083	530 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	PCGF2	P35227	344 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	RBBP4	Q09028	425 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	P2RY6	Q15077	328 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	ACKR1	Q16570	336 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	NRF1	Q16656	503 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	VMAC	Q2NL98	169 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	MMEL1	Q495T6	779 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	STK35	Q8TDR2	534 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	SLC38A4	Q969I6	547 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	MCHR1	Q99705	422 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	TRIM2	Q9C040	744 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	FAM107B	Q9H098	131 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	CMTM6	Q9NX76	183 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	EMC3	Q9P0I2	261 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	ABCA4	P78363	2273 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143		A0A0B4J2E0	115 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143		A0A1B0GX12	115 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143		M0R082	166 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	PDLIM1	O00151	329 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	GPR171	O14626	319 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	SERPINB7	O75635	380 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	HLA-DOB	P13765	273 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	PPP3CB	P16298	524 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	DRD4	P21917	467 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	GRPR	P30550	384 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	SELENOP	P49908	381 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-222	ENST00000557143	SLC25A3	Q00325	362 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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