RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 LMX1BO60663 402 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 TFPTP0C1Z6 253 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ZCCHC18P0CG32 403 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 IDO1P14902 403 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 EPHA3P29320 983 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 GZMKP49863 264 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 PDLIM4P50479 330 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 CRISP3P54108 245 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SLC25A3Q00325 362 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 BNIP2Q12982 314 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 CARTPTQ16568 116 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 MST1LQ2TV78 715 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 IQCCQ4KMZ1 466 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 NXNQ6DKJ4 435 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ANKRD16Q6P6B7 361 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 BRICD5Q6PL45 260 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 VRK2Q86Y07 508 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SLC38A5Q8WUX1 472 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ITCHQ96J02 903 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 PARD6BQ9BYG5 372 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 RMND5AQ9H871 391 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 TPT1P8Q9HAU6 139 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 THAP1Q9NVV9 213 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 RASD1Q9Y272 281 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 IFT52Q9Y366 437 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 FKBP7Q9Y680 259 aa7.12□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 B9A039 149 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 LY6HO94772 140 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 AHSA1O95433 338 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 LGI1O95970 557 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 BCHEP06276 602 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 OR4A8P0C604 315 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 KITP10721 976 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 PRG2P13727 222 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ETFAP13804 333 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ZNF43P17038 809 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 THBS2P35442 1172 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 NR4A2P43354 598 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 DSTNP60981 165 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 GGTLC2Q14390 218 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 MAPK11Q15759 364 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 RNF220Q5VTB9 566 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ATG16L1Q676U5 607 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 FAM166AQ6J272 317 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 NIPAL3Q6P499 406 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 EPHX4Q8IUS5 362 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 PHC2Q8IXK0 858 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ANKRD42Q8N9B4 389 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 OR4F15Q8NGB8 312 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 OR1K1Q8NGR3 316 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 MFSD8Q8NHS3 518 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 STK35Q8TDR2 534 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SLC25A36Q96CQ1 311 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 FOXN4Q96NZ1 517 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 LINC00470Q9BZP3 86 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 RAD21L1Q9H4I0 556 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 CA10Q9NS85 328 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 KCNS2Q9ULS6 477 aa7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 PLCE1Q9P212 2302 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 DSPPQ9NZW4 1301 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 A0A096LPE4 126 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 A0A1W2PPZ6 126 aa7.1□□□□□ -1.27
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