RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.42□□□□□ -1.22
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PTPRB-209ENST00000550857 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.42□□□□□ -1.22
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PTPRB-209ENST00000550857 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
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PTPRB-209ENST00000550857 ACTL7AQ9Y615 435 aa7.41□□□□□ -1.22
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PTPRB-209ENST00000550857 LIMK1P53667 647 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 ARF1P84077 181 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
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