RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 GPX3P22352 226 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 CHMP24386 653 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 ETV4P43268 484 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 AKR1C2P52895 323 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM244Q5VVB8 128 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 LRRN1Q6UXK5 716 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 FEVQ99581 238 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 CENPOQ9BU64 300 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 STEAP1Q9UHE8 339 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 RASD1Q9Y272 281 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 COL4A1P02462 1669 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 BIDP55957 195 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 COL28A1Q2UY09 1125 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 FAM71E1Q6IPT2 247 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 LCN8Q6JVE9 175 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 CLEC2AQ6UVW9 174 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 CROCCP3Q8IVE0 287 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 PSMF1Q92530 271 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 FBXW5Q969U6 566 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 NCOR1O75376 2440 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 MAGEA2P43356 314 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 TSC22D1Q15714 1073 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 TSTQ16762 297 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 BTNL3Q6UXE8 466 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 PGAP1Q75T13 922 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 NPRL2Q8WTW4 380 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 GUCD1Q96NT3 240 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 CHST11Q9NPF2 352 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 SDHAF2Q9NX18 166 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 VAPAQ9P0L0 249 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 CHRNA9Q9UGM1 479 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 EMCNQ9ULC0 261 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 PRR19A6NJB7 356 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 LRRTM2O43300 516 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 LILRB5O75023 590 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 RGS11O94810 467 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 B3GALT4O96024 378 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 SPINK2P20155 84 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 SOX3P41225 446 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 RNF4P78317 190 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 POU4F3Q15319 338 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 OR5W2Q8NH69 310 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 FBXO27Q8NI29 283 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 NT5CQ8TCD5 201 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 ZBTB8AQ96BR9 441 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 CXorf21Q9HAI6 301 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 J3QRK9 145 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 PRAMEF10O60809 474 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 GM2AP17900 193 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 LCN1P31025 176 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 GPNMBQ14956 572 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 LIPNQ5VXI9 398 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 RHBDD2Q6NTF9 364 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 BHLHA9Q7RTU4 235 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 OR1L3Q8NH93 324 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 ABHD4Q8TB40 342 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 GNRHR2Q96P88 292 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 KATNB1Q9BVA0 655 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 OCIAD1Q9NX40 245 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF221Q9UK13 617 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 LNP1A1A4G5 178 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 A1L4Q6 167 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 FABP12A6NFH5 140 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 CLCA1A8K7I4 914 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF732B4DXR9 585 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 CELP19835 753 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 PRKACBP22694 351 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 MAP2K3P46734 347 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 SLC6A12P48065 614 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 SRP9P49458 86 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 PNLIPRP2P54317 469 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 HOXC5Q00444 222 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 ASRGL1Q7L266 308 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 MS4A15Q8N5U1 240 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM105Q8N8V8 129 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 FAM46BQ96A09 425 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 NEURL3Q96EH8 262 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM43Q9BTV4 400 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1B-217ENST00000541869 DDA1Q9BW61 102 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms