RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 ICAM2P13598 275 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 NME2P22392 152 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ITPKAP23677 461 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 HRH2P25021 359 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CCKARP32238 428 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 RFX2P48378 723 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 RBP2P50120 134 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PMPCAQ10713 525 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ARHGAP19Q14CB8 494 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 DHCR24Q15392 516 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 LY6G5CQ5SRR4 150 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-214ENST00000540109 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-214ENST00000540109 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 HORMAD2Q8N7B1 307 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PLA2G15Q8NCC3 412 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 BPIFCQ8NFQ6 507 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OR51G2Q8NGK0 314 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 EID2BQ96D98 161 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 FEVQ99581 238 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 HDAC8Q9BY41 377 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OR51I1Q9H343 314 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 FN3KRPQ9HA64 309 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 DEC1Q9P2X7 70 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CCL27Q9Y4X3 112 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 A0A0U1RQK1 487 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM82A0PJX8 343 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OR2A25A4D2G3 310 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-214ENST00000540109 RENP00797 406 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ARAFP10398 606 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PTNP21246 168 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SDHBP21912 280 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 BDKRB2P30411 391 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 THBS3P49746 956 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PPA1Q15181 289 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SGCAQ16586 387 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 HAGHQ16775 308 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ELOA3BQ3SY89 546 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 P4HA3Q7Z4N8 544 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CAMKMTQ7Z624 323 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PARGQ86W56 976 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 DTWD1Q8N5C7 304 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SPICQ8N5J4 248 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 FRMD1Q8N878 549 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ELOA3Q8NG57 546 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OR52B6Q8NGF0 335 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ADAMTS15Q8TE58 950 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TRBC2A0A5B9 178 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-214ENST00000540109 K7ERU9 68 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SYT7O43581 403 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OR2T1O43869 369 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 THBS1P07996 1170 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TIMP2P16035 220 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 FABP6P51161 128 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TAS2R20P59543 309 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 LCN6P62502 163 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PSPHP78330 225 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ABRAXAS2Q15018 415 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 C2orf76Q3KRA6 126 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 SAXO2Q658L1 398 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TBPL2Q6SJ96 375 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 Q6ZVU0 165 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OVCH2Q7RTZ1 564 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 GPR155Q7Z3F1 870 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 C12orf40Q86WS4 652 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM25Q86YD3 366 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 C1orf87Q8N0U7 546 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PLPP5Q8NEB5 264 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-214ENST00000540109 MRGPRX3Q96LB0 322 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 CXorf58Q96LI9 332 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 UBQLN3Q9H347 655 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 FBXO7Q9Y3I1 522 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PRSS21Q9Y6M0 314 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PI15O43692 258 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PCDH7O60245 1069 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 PTHP01270 115 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 LINC00271P0C7V0 271 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF44P15621 663 aa5.62□□□□□ -1.51
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