RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198	CHRNG	P07510	517 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	ADRA2A	P08913	450 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	OR12D1	P0DN82	309 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	IFNGR1	P15260	489 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	NPR2	P20594	1047 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	DRD4	P21917	467 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	PAX7	P23759	505 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	TACR3	P29371	465 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	SELENOP	P49908	381 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	GUCY1A3	Q02108	690 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	CEACAM7	Q14002	265 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	CCDC153	Q494R4	210 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	AWAT1	Q58HT5	328 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	CFAP157	Q5JU67	520 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	IL23R	Q5VWK5	629 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	SPATA21	Q7Z572	469 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF563	Q8TA94	476 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	PMM1	Q92871	262 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	RAB8B	Q92930	207 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF75A	Q96N20	296 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	DUSP26	Q9BV47	211 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF747	Q9BV97	191 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	OR51I1	Q9H343	314 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	ESM1	Q9NQ30	184 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	TBK1	Q9UHD2	729 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM114	B3SHH9	223 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	FAAH	O00519	579 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	NPIPB7	O75200	414 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	HPX	P02790	462 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	MSMB	P08118	114 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	PRPS1L1	P21108	318 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	PCMT1	P22061	227 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	HPCAL1	P37235	193 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC1A3	P43003	542 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	HTR3A	P46098	478 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	MAP2K6	P52564	334 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	CLDN8	P56748	225 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	ACTG1	P63261	375 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	PCLAF	Q15004	111 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	MAPK11	Q15759	364 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	YIPF5	Q969M3	257 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	ROPN1L	Q96C74	230 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	C1orf50	Q9BV19	199 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	POLE3	Q9NRF9	147 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	TREM2	Q9NZC2	230 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	WDR45	Q9Y484	360 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM4B-208	ENST00000534198	AGAP5	A6NIR3	686 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIM77	I1YAP6	450 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	CFLAR	O15519	480 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIM13	O60858	407 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	RP2	O75695	350 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	SHBG	P04278	402 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	GAA	P10253	952 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	G6PD	P11413	515 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF35	P13682	527 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	NR4A1	P22736	598 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	EVX1	P49640	407 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	SEC24C	P53992	1094 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM33	P57088	247 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	DEFA6	Q01524	100 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	IL1RL1	Q01638	556 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	EPS8	Q12929	822 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	OR7A5	Q15622	319 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	SAXO2	Q658L1	398 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM4B-208	ENST00000534198	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		7.46	□□□□□ -1.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms