RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 CD300CQ08708 224 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 MOGQ16653 247 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 FJX1Q86VR8 437 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 LRGUKQ96M69 825 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 PTDSS2Q9BVG9 487 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC7A7Q9UM01 511 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF175Q9Y473 711 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 AQP12BA6NM10 295 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 PMS2P2O95744 297 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 TFPIP10646 304 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 THRBP10828 461 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 KLK2P20151 261 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 DIO1P49895 249 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 CARD18P57730 90 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 RAC3P60763 192 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 ADORA2A-AS1P86434 159 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP11.39□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 33.9
RPUSD4-208ENST00000533628 ELOA3BQ3SY89 546 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 NKAIN4Q8IVV8 208 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 AQP12AQ8IXF9 295 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 C9orf106Q8NAJ2 232 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 ELOA3Q8NG57 546 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 WNT2BQ93097 391 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 DDIT4LQ96D03 193 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM43Q9BTV4 400 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 TRIM15Q9C019 465 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 IL1RAPQ9NPH3 570 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC5A6Q9Y289 635 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 TRAPPC4Q9Y296 219 aa11.39□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 TRIM64BA6NI03 449 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 NOTOA8MTQ0 251 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 AQP8O94778 261 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC7A1P30825 629 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 TIMP3P35625 211 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 MAGEA2P43356 314 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 TAS2R41P59536 307 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 PON3Q15166 354 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 PDSS1Q5T2R2 415 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 C1orf140Q5VVS0 124 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 ADGRG5Q8IZF4 528 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 OFCC1Q8IZS5 231 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 PIK3C3Q8NEB9 887 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 FNDC9Q8TBE3 224 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 CCDC120Q96HB5 630 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 DOK1Q99704 481 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 MAGIXQ9H6Y5 334 aa11.38□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 WIPF3A6NGB9 483 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 LIPT2A6NK58 231 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 TRIM64CA6NLI5 447 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 FTCDNL1E5RQL4 147 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 H0YJX3 145 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 hCG_2039718K7EN88 272 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 RGS13O14921 159 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 RHCEP18577 417 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 H3F3AP84243 136 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 LTBQ06643 244 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 PMPCAQ10713 525 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 FLOT2Q14254 428 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 ZBED5Q49AG3 693 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 C6orf52Q5T4I8 152 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM211Q6ICI0 200 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 GPR141Q7Z602 305 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 P3H2Q8IVL5 708 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 NAXEQ8NCW5 288 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 LILRB4Q8NHJ6 448 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 DNAJA3Q96EY1 480 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 RHCGQ9UBD6 479 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC22A20A6NK97 555 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF814B7Z6K7 855 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 SULT2B1O00204 365 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 RCBTB2O95199 551 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 ENPP1P22413 925 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 TUBA1BP68363 451 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 ST3GAL3Q11203 375 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 OXA1LQ15070 435 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 SGCBQ16585 318 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 ZFP1Q6P2D0 407 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 TUBA1AQ71U36 451 aa11.37□□□□□ -0.59
RPUSD4-208ENST00000533628 CHMP1BQ7LBR1 199 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms