RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		12.27	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	CIB4	A0PJX0	185 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059		M0R082	166 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	OR5F1	O95221	314 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	OR6A2	O95222	327 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	GOSR1	O95249	250 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	GGT1	P19440	569 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	CALB2	P22676	271 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	GRPR	P30550	384 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	CCKAR	P32238	428 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	P2RY6	Q15077	328 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	POU4F3	Q15319	338 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	STK11	Q15831	433 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	IFI44L	Q53G44	452 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	GLYAT	Q6IB77	296 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	CBLL1	Q75N03	491 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	AAED1	Q7RTV5	226 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	FITM2	Q8N6M3	262 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	TAAR8	Q969N4	342 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	NSL1	Q96IY1	281 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	LURAP1	Q96LR2	239 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	CACNA1D	Q01668	2161 aa		12.26	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	LYZL6	O75951	148 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	HIST1H2AB	P04908	130 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	AHCY	P23526	432 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	HOXC12	P31275	282 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	ST3GAL3	Q11203	375 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	FAP	Q12884	760 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	ITGAD	Q13349	1161 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	PMS2P3	Q13401	168 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	TSC22D1	Q15714	1073 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	NIPAL3	Q6P499	406 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	OR6S1	Q8NH40	331 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM45B	Q96B21	275 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	S100PBP	Q96BU1	408 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	PRRC1	Q96M27	445 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	CDRT15	Q96T59	188 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	OR10A4	Q9H209	315 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	ASB6	Q9NWX5	421 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		12.25	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059		B2RBV5	119 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	CTAG2	O75638	210 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	MT-ATP6	P00846	226 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	CLDN17	P56750	224 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	MED12L	Q86YW9	2145 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	UEVLD	Q8IX04	471 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	KDM8	Q8N371	416 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	SCAI	Q8N9R8	606 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	OXGR1	Q96P68	337 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	NANS	Q9NR45	359 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	RASSF1	Q9NS23	344 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	EDAR	Q9UNE0	448 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059		V9GYQ6	96 aa		12.24	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	ENO4	A6NNW6	628 aa		12.23	□□□□□ -0.45
CHID1-222	ENST00000533059	LRRN3	E7EW58	273 aa		12.23	□□□□□ -0.45

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