RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR10D3Q8NH80 312 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LIPHQ8WWY8 451 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TFAP2CQ92754 450 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MIB2Q96AX9 1013 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TIMP4Q99727 224 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GABARAPL3Q9BY60 117 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR52D1Q9H346 318 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MCCC2Q9HCC0 563 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHST11Q9NPF2 352 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAB26Q9ULW5 256 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SIGLEC7Q9Y286 467 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRRC42Q9Y546 428 aa7.64□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1B0GTH9 108 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZAR1LA6NP61 321 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TTLL8A6PVC2 850 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPIPA2E9PIF3 369 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPIPA3F8WFD2 350 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC16A6O15403 523 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNHIT1O43257 154 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WISP2O76076 250 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYNGR4O95473 234 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPP1R3DO95685 299 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLIC3O95833 236 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HMGN1P05114 100 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 F13BP05160 661 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF708P17019 499 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ENPP1P22413 925 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EPHA2P29317 976 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NOS3P29474 1203 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMSP52788 366 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLDN18P56856 261 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CTXN1P60606 82 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAC3P60763 192 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ERVK-25P63136 954 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSF1Q00613 529 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYBPC1Q00872 1141 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LY6DQ14210 128 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C3AR1Q16581 482 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC27A4Q6P1M0 643 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CASP12Q6UXS9 341 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KDM8Q8N371 416 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCAIQ8N9R8 606 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q8NA96 180 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2T33Q8NG76 320 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SARAFQ96BY9 339 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CNBD2Q96M20 576 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 APOL4Q9BPW4 351 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IMPAD1Q9NX62 359 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TAS2R5Q9NYW4 299 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IL20Q9NYY1 176 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.63□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1B0GVC2 190 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1W2PRG6 482 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MCIDASD6RGH6 385 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MS4A18H0YCH9 400 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AQP7O14520 342 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNPH1O43598 174 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CPN1P15169 458 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACADSP16219 412 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UQCRC1P31930 480 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GGT2P36268 569 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FXYD6P3P58550 94 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDC42P60953 191 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDK5Q00535 292 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IL5RAQ01344 420 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZP4Q12836 540 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IL18R1Q13478 541 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FHL1Q13642 323 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KEAP1Q14145 624 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNAPC1Q16533 368 aa7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PGGHGQ32M88 737 aa7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms