RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529524.1

PSMA1-208, Transcript of proteasome subunit alpha 1, human

TSL 3

Gene PSMA1, Length 743 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA1-208	ENST00000529524	UQCRB	P14927	111 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	VDAC1	P21796	283 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ADORA2B	P29275	332 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PRDX6	P30041	224 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC26A5	P58743	744 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	RND3	P61587	244 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	SEMG2	Q02383	582 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	BPTF	Q12830	3046 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ILK	Q13418	452 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	DPYSL3	Q14195	570 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	DMC1	Q14565	340 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PDGFRL	Q15198	375 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ALX1	Q15699	326 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ALLC	Q8N6M5	410 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ING5	Q8WYH8	240 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	NCLN	Q969V3	563 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	MTMR9	Q96QG7	549 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	LY9	Q9HBG7	655 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ANO10	Q9NW15	660 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ASB3	Q9Y575	518 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		2.55	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	SPEG	Q15772	3267 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	TRIM64B	A6NI03	449 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	LAD1	O00515	517 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	YKT6	O15498	198 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	NMT2	O60551	498 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	GPX5	O75715	221 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	SEMG1	P04279	462 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	FUT3	P21217	361 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	AKT2	P31751	481 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ATP6V1E1	P36543	226 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	VLDLR	P98155	873 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	BDH1	Q02338	343 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF33A	Q06730	810 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF154	Q13106	437 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	TFDP1	Q14186	410 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	PDIA5	Q14554	519 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	CEP55	Q53EZ4	464 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524		Q6ZS52	159 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	MKX	Q8IYA7	352 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	STKLD1	Q8NE28	680 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	MGARP	Q8TDB4	240 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	GIPC3	Q8TF64	312 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	COG4	Q9H9E3	785 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	MARCH5	Q9NX47	278 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	CACNA1E	Q15878	2313 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		2.54	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	FRYL	O94915	3013 aa		2.53	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		2.53	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		2.53	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ARL5C	A6NH57	179 aa		2.53	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	WASH3P	C4AMC7	463 aa		2.53	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	ABCD4	O14678	606 aa		2.53	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	LAT	O43561	262 aa		2.53	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	STX11	O75558	287 aa		2.53	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	SCRG1	O75711	98 aa		2.53	□□□□□ -2
PSMA1-208	ENST00000529524	B3GAT3	O94766	335 aa		2.53	□□□□□ -2

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