RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM221A6NGB7 291 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 FRG2CA6NGY1 282 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 METTL15A6NJ78 407 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 M0R296 226 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 DCTN6O00399 190 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 KLF4O43474 513 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 FMO6PO60774 539 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 CER1O95813 267 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 TCN2P20062 427 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 PGCP20142 388 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 LTBQ06643 244 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 C3orf38Q5JPI3 329 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 CARD17Q5XLA6 110 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 GID4Q8IVV7 300 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 C17orf47Q8NEP4 570 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 BARHL1Q9BZE3 327 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 HOXD1Q9GZZ0 328 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF337Q9Y3M9 751 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 U3KQA8 63 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 A0A1W2PNR3 127 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 PTP4A3O75365 173 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 PIPP12273 146 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 PRKCAP17252 672 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 EDNRAP25101 427 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 ETFDHQ16134 617 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 HYAL4Q2M3T9 481 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 PYDC2Q56P42 97 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 OVCH1Q7RTY7 1134 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 DPY19L4Q7Z388 723 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 RDH10Q8IZV5 341 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 LSMEM1Q8N8F7 131 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 TWSG1Q9GZX9 223 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 TMED7Q9Y3B3 224 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 DMXL1Q9Y485 3027 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 C9J4A7 227 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 NPIPB9F8W1W9 429 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 H3BMH7 237 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 GABRPO00591 440 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 OR7A10O76100 309 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 OR8G3PP0DMU2 310 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 SDHBP21912 280 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 GPR85P60893 370 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 MEP1BQ16820 701 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 DTWD2Q8NBA8 298 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 S100ZQ8WXG8 99 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 NSMAFQ92636 917 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 GHSRQ92847 366 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF160Q9HCG1 818 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 A0A087WV48 116 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 FABP12A6NFH5 140 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 PPM1BO75688 479 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 PAHP00439 452 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 MT-ND5P03915 603 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 EGR4Q05215 589 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 PRSS42Q7Z5A4 293 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 APCDD1LQ8NCL9 501 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 CMKLR1Q99788 373 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 TRIM36Q9NQ86 728 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 MED29Q9NX70 200 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 COL4A2P08572 1712 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 A0A0B4J203 849 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 BLACEA4D250 179 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 D6RAR5 112 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 E9PQ18 207 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 SLC16A7O60669 478 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 AHSA1O95433 338 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 HLA-DPB1P04440 258 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 HLA-DOBP13765 273 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 INPP1P49441 399 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 OR10A3P58181 314 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 LGALS3BPQ08380 585 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 ANGPT1Q15389 498 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 UBQLNLQ8IYU4 475 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF248Q8NDW4 579 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-216ENST00000524481 GNRHR2Q96P88 292 aa10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 179.2 ms