RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR6T1Q8NGN1 323 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR5M1Q8NGP8 315 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR1J4Q8NGS1 313 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR5W2Q8NH69 310 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 GPR119Q8TDV5 335 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 RASSF5Q8WWW0 418 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 TM9SF4Q92544 642 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLCO4A1Q96BD0 722 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF524Q96C55 264 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 C7orf34Q96L11 122 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 MCHR1Q99705 422 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM173AQ9BQD7 235 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 RNF32Q9H0A6 362 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 DEFB127Q9H1M4 99 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLEKHA2Q9HB19 425 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM27Q9HBJ8 222 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CTPS2Q9NRF8 586 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 RHCGQ9UBD6 479 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 FBXL2Q9UKC9 423 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ICAM5Q9UMF0 924 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ABCG2Q9UNQ0 655 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 AP4S1Q9Y587 144 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 DHRS12A0PJE2 317 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 A8MXE2 369 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 B4DXG7 233 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 FFAR1O14842 300 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 RGS10O43665 173 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 EFNA2O43921 213 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 NME2P1O60361 137 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 DPM1O60762 260 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 SEC14L2O76054 403 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 GOSR1O95249 250 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 NUDT14O95848 222 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 KNG1P01042 644 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGLV1-40P01703 118 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 MT-ND1P03886 318 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 OPN1LWP04000 364 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 GP1BBP13224 206 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 HK1P19367 917 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCNA2P20248 432 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 DPP4P27487 766 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 GCH1P30793 250 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 MEOX1P50221 254 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 P2RX1P51575 399 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCR4P51679 360 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF136P52737 540 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 COPZ1P61923 177 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPIAP62937 165 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLGLB1Q02325 96 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 SKP2Q13309 424 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 LY6DQ14210 128 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC10A1Q14973 349 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 NPTX1Q15818 432 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 NRF1Q16656 503 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 ST3GAL2Q16842 350 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 NADK2Q4G0N4 442 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 IQCCQ4KMZ1 466 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 EIPR1Q53HC9 387 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 MTX3Q5HYI7 312 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM81Q6P7N7 255 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARSKQ6UWY0 536 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 DEF8Q6ZN54 512 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 Q6ZS92 163 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF550Q7Z398 422 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 AMIGO2Q86SJ2 522 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 ADGRG3Q86Y34 549 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 MISPQ8IVT2 679 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF440Q8IYI8 595 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 ADGRG5Q8IZF4 528 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 CADM2Q8N3J6 435 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 FADS6Q8N9I5 356 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 POMGNT2Q8NAT1 580 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR2M3Q8NG83 312 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR4K17Q8NGC6 315 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF563Q8TA94 476 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 RNF138Q8WVD3 245 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 PYDC1Q8WXC3 89 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC47A1Q96FL8 570 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 SCMH1Q96GD3 660 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARHGDIGQ99819 225 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF559Q9BR84 538 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 OSBPL11Q9BXB4 747 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-205ENST00000519068 TEX12Q9BXU0 123 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms