RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516232.1

RNA5SP228-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 228, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP228, Length 133 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP228-201ENST00000516232 TRIM36Q9NQ86 728 aa4.56□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 CUTCQ9NTM9 273 aa4.56□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 PLEK2Q9NYT0 353 aa4.56□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 COPS7AQ9UBW8 275 aa4.56□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 FOXJ3Q9UPW0 622 aa4.56□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa4.56□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.56□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 CLIC4Q9Y696 253 aa4.56□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 V9GYQ6 96 aa4.56□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 TMEM129A0AVI4 362 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 TMEM82A0PJX8 343 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 TMEM89A2RUT3 159 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 METTL21EPA6NDL7 271 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 TMEM247A6NEH6 219 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 FAM166BA8MTA8 275 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 SERPINE3A8MV23 424 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 C2orf74A8MZ97 194 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 E5RI56 91 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 FFAR3O14843 346 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 GPR42O15529 346 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 KIAA0513O60268 411 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 WDR1O75083 606 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 ERN1O75460 977 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 H6PDO95479 791 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 IFNA6P05013 189 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 FABP1P07148 127 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 NR2F6P10588 404 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 ICAM2P13598 275 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 GYPEP15421 78 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 TPSB2P20231 275 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 CNR1P21554 472 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 EPHA3P29320 983 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 PRDX2P32119 198 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 SPINT3P49223 89 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 SERPINB8P50452 374 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 LOXL3P58215 753 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 MYBPC1Q00872 1141 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 SLC34A1Q06495 639 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 SCRN3Q0VDG4 424 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 STX3Q13277 289 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 CUL3Q13618 768 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 NR1I3Q14994 352 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 TRIP10Q15642 601 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 TPSAB1Q15661 275 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 TSC22D1Q15714 1073 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 EXT1Q16394 746 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 PTPN20Q4JDL3 420 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 CDONQ4KMG0 1287 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 KLHL22Q53GT1 634 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 LGSNQ5TDP6 509 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 RNLSQ5VYX0 342 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 VASNQ6EMK4 673 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 TRNP1Q6NT89 227 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 SPESP1Q6UW49 350 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 C22orf34Q6ZV56 151 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 PRSS45Q7RTY3 260 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 NRARPQ7Z6K4 114 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 ANKRD46Q86W74 232 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 TDRPQ86YL5 185 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 LAX1Q8IWV1 398 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 ZNF786Q8N393 782 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 CCDC185Q8N715 623 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 TMEM104Q8NE00 496 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 OR2L3Q8NG85 312 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 OR13C3Q8NGS6 347 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 GIPC3Q8TF64 312 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 PIH1D2Q8WWB5 315 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 LCN9Q8WX39 176 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 IGFBPL1Q8WX77 278 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 GLYATL1Q969I3 302 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 HS3ST6Q96QI5 342 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 VPS35Q96QK1 796 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 FEVQ99581 238 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 CPNE1Q99829 537 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 C20orf24Q9BUV8 137 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 HDHD5Q9BXW7 423 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 CXorf36Q9H7Y0 433 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 LYRM4Q9HD34 91 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 C12orf4Q9NQ89 552 aa4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNA5SP228-201ENST00000516232 NDE1Q9NXR1 346 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 147.3 ms