RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 NHSL2Q5HYW2 709 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 HMBOX1Q6NT76 420 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00114Q6XXX2 140 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF730Q6ZMV8 503 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ADGRG3Q86Y34 549 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 HIPK1Q86Z02 1210 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 NKAIN4Q8IVV8 208 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 CDK20Q8IZL9 346 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 LILRA2Q8N149 483 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ICA1LQ8NDH6 482 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 LINC01560Q8TB33 94 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 GIPC3Q8TF64 312 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM239Q8WW34 195 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 DDIT4LQ96D03 193 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 WDYHV1Q96HA8 205 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 SFXN2Q96NB2 322 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM43Q9BTV4 400 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 SLC19A3Q9BZV2 496 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 KLHL4Q9C0H6 718 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 RASSF4Q9H2L5 321 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 CHRNA9Q9UGM1 479 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 MED31Q9Y3C7 131 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 U3KQV3 271 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 MPDZO75970 2070 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 NCKAP5O14513 1909 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 OR2M5A3KFT3 312 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 GJE1A6NN92 205 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 A8MVM7 634 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 G3V2T6 193 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 LYPD3O95274 346 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ACTL6AO96019 429 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 THY1P04216 161 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 TFPIP10646 304 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 EPXP11678 715 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF23P17027 643 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 CCNA2P20248 432 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 CHMP24386 653 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 OPRM1P35372 400 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 LIMS1P48059 325 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 RAC1P63000 192 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 SRYQ05066 204 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 SELENBP1Q13228 472 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 KEAP1Q14145 624 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 MICAQ29983 383 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM44Q2T9K0 475 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 C3orf33Q6P1S2 294 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 PODNL1Q6PEZ8 512 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 PAMR1Q6UXH9 720 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 C9orf106Q8NAJ2 232 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 OR4C15Q8NGM1 316 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 POC1BQ8TC44 478 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 SLC7A13Q8TCU3 470 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 STK35Q8TDR2 534 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF524Q96C55 264 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 PRSS27Q9BQR3 290 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 OSBPL10Q9BXB5 764 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 POTEKPQ9BYX7 375 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 NTN4Q9HB63 628 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJC13O75165 2243 aa10.15□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 A0A087WUU8 490 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM72A0PK05 275 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SH3PXD2BA1X283 911 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OR2T1O43869 369 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OR10H3O60404 316 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 IGF2P01344 180 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 RAF1P04049 648 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PEPDP12955 493 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ANXA8P13928 327 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 FOXF2Q12947 444 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 POU4F3Q15319 338 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PLXDC2Q6UX71 529 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 LUZP2Q86TE4 346 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 STK32CQ86UX6 486 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OR4K5Q8NGD3 323 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OR5M1Q8NGP8 315 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PIGXQ8TBF5 258 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM255BQ8WV15 326 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 EME1Q96AY2 570 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TUBA1CQ9BQE3 449 aa10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.4 ms