RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 SLC9A6Q92581 669 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ANKRA2Q9H9E1 313 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 NOX4Q9NPH5 578 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 OPN4Q9UHM6 478 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TM9SF1O15321 606 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 SCN2BO60939 215 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 SLU7O95391 586 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 BMP2P12643 396 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 MATN1P21941 496 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CALCRP30988 508 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM54Q969K7 222 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 EBPLQ9BY08 206 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 BCL2L10Q9HD36 194 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 OR2T1O43869 369 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 SEC22BO75396 215 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 MMP16P51512 607 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CDH13P55290 713 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 PLAURQ03405 335 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 HSPB3Q12988 150 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 DAG1Q14118 895 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ADRM1Q16186 407 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 COX20Q5RI15 118 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 OGFOD2Q6N063 350 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CASP12Q6UXS9 341 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 SLC38A4Q969I6 547 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF524Q96C55 264 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TIMM23O14925 209 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 FOXH1O75593 365 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 BCL10O95999 233 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ARAFP10398 606 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 EDNRAP25101 427 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ATP4BP51164 291 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 OR2B6P58173 313 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 KCNJ10P78508 379 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 PDZK1Q5T2W1 519 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TREML4Q6UXN2 200 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 OR2T11Q8NH01 316 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ROPN1LQ96C74 230 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 DPH5Q9H2P9 285 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 MMP27Q9H306 513 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 C16orf95Q9H693 158 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 GPR35Q9HC97 309 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 IFT52Q9Y366 437 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1W2PNR3 127 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 M0R233 179 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 FMO6PO60774 539 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 OR52N5Q8NH56 324 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF519Q8TB69 540 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 FMO2Q99518 471 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 DUSP26Q9BV47 211 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 NUP50Q9UKX7 468 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CFAP73A6NFT4 308 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV3-13P01766 116 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 PNMTP11086 282 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 MTNR1AP48039 350 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 GNG11P61952 73 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 FUT5Q11128 374 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.61□□□□□ -1.35
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