RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 NTNG1Q9Y2I2 539 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 CACNA1HO95180 2353 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 DPM1O60762 260 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 AKR7A3O95154 331 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 UCNP55089 124 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 CAMK2DQ13557 499 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF766Q5HY98 468 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 GLT8D1Q68CQ7 371 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 VASNQ6EMK4 673 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF101Q8IZC7 436 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 OR5M1Q8NGP8 315 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ASB17Q8WXJ9 295 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 SLCO4A1Q96BD0 722 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 RASL10BQ96S79 203 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 MNTQ99583 582 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 FN3KQ9H479 309 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 MMP25Q9NPA2 562 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 RASD1Q9Y272 281 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PS29 197 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 APLNRP35414 380 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF91Q05481 1191 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 COMMD3Q9UBI1 195 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 CDRT1O95170 752 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ITGA5P08648 1049 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 IFI6P09912 130 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 IL32P24001 234 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 PPP2R2BQ00005 443 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 FOXF1Q12946 379 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 CRMP1Q14194 572 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 DCAF10Q5QP82 559 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 NMNAT3Q96T66 252 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ALG12Q9BV10 488 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 MFRPQ9BY79 579 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 CALHM2Q9HA72 323 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ACOT13Q9NPJ3 140 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 OSGIN1Q9UJX0 560 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 GPR179Q6PRD1 2367 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 H3BSA7 217 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 CD1EP15812 388 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 TMBIM6P55061 237 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF117Q03924 483 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 PRKCDQ05655 676 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 RAB39AQ14964 217 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 BEST3Q8N1M1 668 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 NEIL3Q8TAT5 605 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 OR11A1Q9GZK7 315 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ABCB9Q9NP78 766 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 PSMD9O00233 223 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 PTHP01270 115 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 CDK1P06493 297 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 TPTEP56180 551 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 RHAGQ02094 409 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 FZD5Q13467 585 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 MELKQ14680 651 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 STK11Q15831 433 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 EMC4Q5J8M3 183 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 MUCL1Q96DR8 90 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 FAM117AQ9C073 453 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-211ENST00000486161 A0A087WUJ7 227 aa7.54□□□□□ -1.2
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