RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TMEM43Q9BTV4 400 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 SEC14L4Q9UDX3 406 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 RASD1Q9Y272 281 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 CSMD2Q7Z408 3487 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PPR1 153 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 CHP2O43745 196 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 DCTN3O75935 186 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 IGHV1-2P23083 117 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 SELENOWP63302 87 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 WDR88Q6ZMY6 472 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 GPAT4Q86UL3 456 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 EPYCQ99645 322 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 ALG2Q9H553 416 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 ARL8BQ9NVJ2 186 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 PARPBPQ9NWS1 579 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 AKAP6Q13023 2319 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 LRBAP50851 2863 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 PRR14LQ5THK1 2151 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 TRAPPC13A5PLN9 417 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 M0R082 166 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 CXCR6O00574 342 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 NDUFAB1O14561 156 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 BGLAPP02818 100 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 COX5AP20674 150 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 PTNP21246 168 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 IL32P24001 234 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 LOXP28300 417 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 GRPRP30550 384 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 FBXW10Q5XX13 1052 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 CASP12Q6UXS9 341 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 CDH24Q86UP0 819 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 EPHX4Q8IUS5 362 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 KDM8Q8N371 416 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 ZNF417Q8TAU3 575 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 LIME1Q9H400 295 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 TAGLN3Q9UI15 199 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 SLC7A7Q9UM01 511 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 GSTA4O15217 222 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 KLF4O43474 513 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 LYZL6O75951 148 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 CBLP22681 906 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 OR1E2P47887 323 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 TSPO2Q5TGU0 170 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 CREB3L2Q70SY1 520 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 AAED1Q7RTV5 226 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 UBE2J2Q8N2K1 259 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 SLC41A3Q96GZ6 507 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 TPD52L3Q96J77 140 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 PRSS27Q9BQR3 290 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 SPAG4Q9NPE6 437 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 B3GAT1Q9P2W7 334 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 MALT1Q9UDY8 824 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 LRRN3E7EW58 273 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 PDLIM1O00151 329 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 FAM107AO95990 144 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 MFSD13AQ14CX5 517 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 TAB1Q15750 504 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 DEF8Q6ZN54 512 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 PIK3IP1Q96FE7 263 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 MPP4Q96JB8 637 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 OXGR1Q96P68 337 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 MOGAT1Q96PD6 335 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 ZNF426Q9BUY5 554 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 SLC7A10Q9NS82 523 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 ASB6Q9NWX5 421 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 MS4A18H0YCH9 400 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 FAPQ12884 760 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 MS4A18Q3C1V0 323 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 CBLL1Q75N03 491 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 VTCN1Q7Z7D3 282 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 WFDC8Q8IUA0 241 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 FITM2Q8N6M3 262 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 HSD17B8Q92506 261 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 ADAM21Q9UKJ8 722 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 CORINQ9Y5Q5 1042 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 CCDC168Q8NDH2 2452 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 TACC2O95359 2948 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 OR5F1O95221 314 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 HPRP00739 348 aa18.46■□□□□ 0.55
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