RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 FCRLBQ6BAA4 426 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 MORN4Q8NDC4 146 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 INPP5EQ9NRR6 644 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 MGAT4CQ9UBM8 478 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 HIF3AQ9Y2N7 669 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 SCN4AP35499 1836 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 PMS2P1A4D2B8 440 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 F5H5K5 113 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 CSO75390 466 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 PRR35P0CG20 571 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 RGS6P49758 472 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 SLC26A5P58743 744 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 RHEBQ15382 184 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 GRK1Q15835 563 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 SLC6A20Q9NP91 592 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 BTN1A1Q13410 526 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 NTRK2Q16620 822 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 ZNF750Q32MQ0 723 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 PRAMEF20Q5VT98 475 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 KIAA1211LQ6NV74 962 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 DUSP19Q8WTR2 217 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 MS4A6EQ96DS6 147 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 ELP4Q96EB1 424 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 STACQ99469 402 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 ZNF587BE7ETH6 402 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 PIGAP37287 484 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 PPP2CBP62714 309 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 PPP2CAP67775 309 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 TSPAN31Q12999 210 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 AGBL4Q5VU57 503 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 ZNF417Q8TAU3 575 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 ZNF566Q969W8 418 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 FIGNL2A6NMB9 653 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 ZNF850A8MQ14 1090 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 ETHE1O95571 254 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 PAHP00439 452 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 PITPNBP48739 271 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 METAP1P53582 386 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 TMEM69Q5SWH9 247 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 RTL6Q6ICC9 239 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 BEND4Q6ZU67 534 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 DNAJC22Q8N4W6 341 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 TMEM163Q8TC26 289 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 GPR148Q8TDV2 347 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 CENPOQ9BU64 300 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 ALG8Q9BVK2 526 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 TEX101Q9BY14 249 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 LYRM1O43325 122 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 RAB3AP20336 220 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 SLC19A1P41440 591 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 TMEM215Q68D42 235 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 HBMQ6B0K9 141 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 PARP16Q8N5Y8 322 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 CCDC74BQ96LY2 380 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 NPAP1Q9NZP6 1156 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 CRYABP02511 175 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 RAB3BP20337 219 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 PRPH2P23942 346 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 ALDH3B2P48448 385 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 ATP1B3P54709 279 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 FAM219BQ5XKK7 198 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 KDM4DQ6B0I6 523 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 AWAT2Q6E213 333 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 LOC100509620A0A075B734 347 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 STMND1H3BQB6 276 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 SYT5O00445 386 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 NKPD1Q17RQ9 610 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 ZNF385BQ569K4 471 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 MKXQ8IYA7 352 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 CADM3Q8N126 398 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 MUL1Q969V5 352 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 MRGPRX3Q96LB0 322 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 SNX18Q96RF0 628 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 TAS2R8Q9NYW2 309 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 ZNF91Q05481 1191 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 DUSP7Q16829 419 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 TCTN1Q2MV58 587 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 PGGHGQ32M88 737 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 SYT3Q9BQG1 590 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 A0A1W2PPE2 198 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 A0A1W2PR64 198 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 A0A1W2PRV1 198 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 TCRBV5S2A0A599 114 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-207ENST00000479054 ILKQ13418 452 aa12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms