RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475319.1

ECHDC1-215, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ECHDC1, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM179Q6ZVK1 233 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 FUNDC1Q8IVP5 155 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 OR11H7Q8NGC8 314 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 OR13C8Q8NGS7 320 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 OR10R2Q8NGX6 335 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 ABHD4Q8TB40 342 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM163Q8TC26 289 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 CXorf40AQ8TE69 158 aa5.5□□□□□ -1.53
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ECHDC1-215ENST00000475319 TFAP2BQ92481 460 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 HSD17B8Q92506 261 aa5.5□□□□□ -1.53
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ECHDC1-215ENST00000475319 BPIFA2Q96DR5 249 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 ALG14Q96F25 216 aa5.5□□□□□ -1.53
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ECHDC1-215ENST00000475319 TKTL2Q9H0I9 626 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 PRO1933Q9H354 126 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 CHODLQ9H9P2 273 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 MSL2Q9HCI7 577 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 FZD3Q9NPG1 666 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 CHRAC1Q9NRG0 131 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 TUBG2Q9NRH3 451 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 FOXJ2Q9P0K8 574 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
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ECHDC1-215ENST00000475319 CDYLQ9Y232 598 aa5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 A0A087WUJ7 227 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 A0A096LPI6 279 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 A0A1W2PRV1 198 aa5.49□□□□□ -1.53
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ECHDC1-215ENST00000475319 OR14I1A6ND48 311 aa5.49□□□□□ -1.53
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ECHDC1-215ENST00000475319 GPR42O15529 346 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 CYB5BO43169 146 aa5.49□□□□□ -1.53
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ECHDC1-215ENST00000475319 SMSP52788 366 aa5.49□□□□□ -1.53
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ECHDC1-215ENST00000475319 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
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ECHDC1-215ENST00000475319 TAF9Q16594 264 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 FAM187BQ17R55 369 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 SMIM21Q3B7S5 101 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 PYDC2Q56P42 97 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM244Q5VVB8 128 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 LIPKQ5VXJ0 399 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 STEAP4Q687X5 459 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 NCR3LG1Q68D85 454 aa5.49□□□□□ -1.53
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ECHDC1-215ENST00000475319 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF620Q6ZNG0 422 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 MOB3CQ70IA8 216 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 TCF24Q7RTU0 167 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF367Q7RTV3 350 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 PID1Q7Z2X4 250 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 FAM220AQ7Z4H9 259 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 VTCN1Q7Z7D3 282 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 MTURNQ8N3F0 131 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 FBXO39Q8N4B4 442 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 COMMD1Q8N668 190 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 OR56B1Q8NGI3 324 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 OR11L1Q8NGX0 322 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 OR10K1Q8NGX5 313 aa5.49□□□□□ -1.53
ECHDC1-215ENST00000475319 FAM222BQ8WU58 562 aa5.49□□□□□ -1.53
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