RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473191.1

USP40-212, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 3

Gene USP40, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-212ENST00000473191 AQP1P29972 269 aa14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 TUBA1BP68363 451 aa14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 TUBA4AP68366 448 aa14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 SELPLGQ14242 412 aa14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 ADRM1Q16186 407 aa14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 NIPAL3Q6P499 406 aa14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 DLEU7Q6UYE1 221 aa14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 TUBA1AQ71U36 451 aa14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 WDFY1Q8IWB7 410 aa14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 NELFAQ9H3P2 528 aa14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 ALG2Q9H553 416 aa14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 B3GAT1Q9P2W7 334 aa14.58□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.57□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 A0A1B0GWA3 101 aa14.57□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 TMEM247A6NEH6 219 aa14.57□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 C5orf58C9J3I9 102 aa14.57□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.57□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 SSX4O60224 188 aa14.57□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 CDK6Q00534 326 aa14.57□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.57□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 STK35Q8TDR2 534 aa14.57□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 TAAR8Q969N4 342 aa14.57□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.57□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 SEC61A2Q9H9S3 476 aa14.57□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.57□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.57□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 A0A096LPE4 126 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 A0A1W2PPZ6 126 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 GPRIN2O60269 458 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 LY6HO94772 140 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 AHSA1O95433 338 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 ETS2P15036 469 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 PRKAR1BP31321 381 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 FABP6P51161 128 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 CLDN17P56750 224 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 DMTNQ08495 405 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 AGAP6Q5VW22 663 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 RETREG3Q86VR2 466 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 MUC15Q8N387 334 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 C17orf78Q8N4C9 275 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 OR1K1Q8NGR3 316 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 ZNF385DQ9H6B1 395 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 MOKQ9UQ07 419 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 MGAT4BQ9UQ53 548 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.56□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 A0A096LNT2 108 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 LRRN3E7EW58 273 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 M0R082 166 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 GPX2P18283 190 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 SCARB2Q14108 478 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 SQLEQ14534 574 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 PHYHD1Q5SRE7 291 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 REEP3Q6NUK4 255 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 PTOV1Q86YD1 416 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 LSMEM1Q8N8F7 131 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 SMYD1Q8NB12 490 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 ELOA3Q8NG57 546 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 ZNF417Q8TAU3 575 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 RADILQ96JH8 1075 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 RASD1Q9Y272 281 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 GMEB1Q9Y692 573 aa14.55□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.54□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 FZD7O75084 574 aa14.54□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 ZNF432O94892 652 aa14.54□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 HPRP00739 348 aa14.54□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 OPN1SWP03999 348 aa14.54□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 CELA3BP08861 270 aa14.54□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 HLA-DOBP13765 273 aa14.54□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 GRPRP30550 384 aa14.54□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 ATP4BP51164 291 aa14.54□□□□□ -0.08
USP40-212ENST00000473191 MTPNP58546 118 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms