RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 TEX46H3BTG2 121 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 IMPA2O14732 288 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 IFNA16P05015 189 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 RUNX2Q13950 521 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 CBFBQ13951 182 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 USP53Q70EK8 1073 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 OR5M1Q8NGP8 315 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 OR1S1Q8NH92 325 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 HAVCR1Q96D42 359 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 SGTBQ96EQ0 304 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 FKRPQ9H9S5 495 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 DUSP22Q9NRW4 184 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 C14orf105Q9NVL8 296 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 PRR32B1ATL7 298 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 MCIDASD6RGH6 385 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 ACOT7O00154 380 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 SIX6O95475 246 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 PLPP4Q5VZY2 271 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 DNM1P46Q6ZS02 220 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 NAXDQ8IW45 347 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 RAB40AQ8WXH6 277 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 TRPV4Q9HBA0 871 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 GLS2Q9UI32 602 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF281Q9Y2X9 895 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 SPTBP11277 2137 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 GXYLT2A0PJZ3 443 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 PSMD9O00233 223 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 BRINP1O60477 761 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 ZFPL1O95159 310 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 PPP3CBP16298 524 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 DIO1P49895 249 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 TAS2R20P59543 309 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 FGL2Q14314 439 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 ZMYND11Q15326 602 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 DEFB134Q4QY38 66 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 AGBL4Q5VU57 503 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 ZPLD1Q8TCW7 415 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 LRFN5Q96NI6 719 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 DEC1Q9P2X7 70 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 DAPP1Q9UN19 280 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 SCAMP1O15126 338 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 P2RX6O15547 441 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 CALCBP10092 127 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 MNDAP41218 407 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 MAP3K8P41279 467 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 VIPR2P41587 438 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 OR7E24Q6IFN5 339 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 SLC43A2Q8N370 569 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 CDRT4Q8N9R6 151 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 DNAAF1Q8NEP3 725 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 NT5CQ8TCD5 201 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 NSMAFQ92636 917 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 MIB2Q96AX9 1013 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 STACQ99469 402 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 SEMA4CQ9C0C4 833 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 ARL6Q9H0F7 186 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 LDB3O75112 727 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM127O75204 238 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 CEACAM5P06731 702 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 SMIM10L1P0DMW3 83 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 ADRA2CP18825 462 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 RBM34P42696 430 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 DLX5P56178 289 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 STX4Q12846 297 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 MELKQ14680 651 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 PON3Q15166 354 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 GSG1LQ6UXU4 331 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 STAC2Q6ZMT1 411 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 NPEPL1Q8NDH3 523 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 SUSD6Q92537 303 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00886-201ENST00000472943 SMIM10Q96HG1 83 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms