RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.08□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.08□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ASB6Q9NWX5 421 aa8.08□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 UPB1Q9UBR1 384 aa8.08□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SEC14L4Q9UDX3 406 aa8.08□□□□□ -1.12
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SYN3-211ENST00000472027 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa8.08□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.08□□□□□ -1.12
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SYN3-211ENST00000472027 SLC7A2P52569 658 aa8.07□□□□□ -1.12
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SYN3-211ENST00000472027 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SELENOWP63302 87 aa8.07□□□□□ -1.12
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SYN3-211ENST00000472027 STK11Q15831 433 aa8.07□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 MS4A18Q3C1V0 323 aa8.07□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 TIMM23BQ5SRD1 257 aa8.07□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 NIPAL3Q6P499 406 aa8.07□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 PAMR1Q6UXH9 720 aa8.07□□□□□ -1.12
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SYN3-211ENST00000472027 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
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SYN3-211ENST00000472027 PROX1Q92786 737 aa8.07□□□□□ -1.12
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SYN3-211ENST00000472027 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
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SYN3-211ENST00000472027 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.06□□□□□ -1.12
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SYN3-211ENST00000472027 LRRN3E7EW58 273 aa8.06□□□□□ -1.12
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SYN3-211ENST00000472027 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 RAD51DO75771 328 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ATE1O95260 518 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 PLAUP00749 431 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ITGA5P08648 1049 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ZNF43P17038 809 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 OR1E2P47887 323 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SELENOPP49908 381 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 CLDN17P56750 224 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 PSME3P61289 254 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 MFSD13AQ14CX5 517 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 PPA1Q15181 289 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 GABRA6Q16445 453 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ACKR1Q16570 336 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 NCMAPQ5T1S8 102 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 C9orf135Q5VTT2 229 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 P2RY8Q86VZ1 359 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 C10orf53Q8N6V4 93 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 POMGNT2Q8NAT1 580 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 MUCL1Q96DR8 90 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SLC41A3Q96GZ6 507 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 TPD52L3Q96J77 140 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 MOGAT1Q96PD6 335 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 FOXC2Q99958 501 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ASPNQ9BXN1 380 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 ALG2Q9H553 416 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.06□□□□□ -1.12
SYN3-211ENST00000472027 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.06□□□□□ -1.12
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