RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 MAZP56270 477 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 SNAPC3Q92966 411 aa16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 DERL3Q96Q80 235 aa16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 RXFP3Q9NSD7 469 aa16.75■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 FAM171A2A8MVW0 826 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 IL10RAQ13651 578 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 SLC22A10Q63ZE4 541 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 WBP2NLQ6ICG8 309 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF527Q8NB42 609 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 MOSPD2Q8NHP6 518 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa16.74■□□□□ 0.27
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SYNE4-204ENST00000465425 GPR174Q9BXC1 333 aa16.74■□□□□ 0.27
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SYNE4-204ENST00000465425 ZNF281Q9Y2X9 895 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 KNL1Q8NG31 2342 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 USP34Q70CQ2 3546 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 A0A0C4DFX4 3053 aa16.74■□□□□ 0.27
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SYNE4-204ENST00000465425 HSD17B7P56937 341 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 KLHL26Q53HC5 615 aa16.74■□□□□ 0.27
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SYNE4-204ENST00000465425 PRSS45Q7RTY3 260 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 SLC35F3Q8IY50 421 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 IZUMO1Q8IYV9 350 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 Q96M85 177 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 CMTM3Q96MX0 182 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 DDOQ99489 341 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 ORAI3Q9BRQ5 295 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC61Q9BV99 259 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 C2orf42Q9NWW7 574 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 CLDN16Q9Y5I7 305 aa16.74■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 COL4A2P08572 1712 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 TRABD2BA6NFA1 517 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 IDSB3KWA1 339 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 ANXA3P12429 323 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 AQP2P41181 271 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 HES5Q5TA89 166 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 CD276Q5ZPR3 534 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 MTFR2Q6P444 385 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa16.73■□□□□ 0.27
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SYNE4-204ENST00000465425 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 LUZP2Q86TE4 346 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF615Q8N8J6 731 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 SMIM4Q8WVI0 70 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 ORAI1Q96D31 301 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 KLHDC7BQ96G42 594 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 SLC25A18Q9H1K4 315 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 AIPO00170 330 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 CTDSPLO15194 276 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 MT-ND4P03905 459 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 UBL4AP11441 157 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 RAB30Q15771 203 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 ALG10Q5BKT4 473 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 CMTM4Q8IZR5 234 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 OR11H7Q8NGC8 314 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 OR51Q1Q8NH59 317 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 CLIP3Q96DZ5 547 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 LMF1Q96S06 567 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 AUNIPQ9H7T9 357 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 EMC7Q9NPA0 242 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 UBQLN4Q9NRR5 601 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 SOHLH2Q9NX45 425 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 RABL2BQ9UNT1 228 aa16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa16.72■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 IFITM5A6NNB3 132 aa16.72■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 SCDO00767 359 aa16.72■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 TSC22D2O75157 780 aa16.72■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 ZFPL1O95159 310 aa16.72■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 TACSTD2P09758 323 aa16.72■□□□□ 0.27
SYNE4-204ENST00000465425 H2AFB2P0C5Z0 115 aa16.72■□□□□ 0.27
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