RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 TSPAN2O60636 221 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 DPM1O60762 260 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SPAG7O75391 227 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 STX11O75558 287 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TSPAN12O95859 305 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TRBC1P01850 177 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MT-ND2P03891 347 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 GP1BAP07359 652 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM191BP0C7N4 346 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PSKH1P11801 424 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ADRB3P13945 408 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CCNB1P14635 433 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MYOD1P15172 320 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PSMC3P17980 439 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 IMPDH1P20839 514 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 UQCRC2P22695 453 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 LHCGRP22888 699 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PAX6P26367 422 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 GJB2P29033 226 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 OR1E1P30953 314 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 LCN1P31025 176 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MPIP34949 423 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 GNPDA1P46926 289 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SRP9P49458 86 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 RGS6P49758 472 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 NDST2P52849 883 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PSME3P61289 254 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 IL9RQ01113 521 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SRYQ05066 204 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 LRRC63Q05C16 580 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CNTN1Q12860 1018 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 DLG1Q12959 904 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TSPAN31Q12999 210 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SELENBP1Q13228 472 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SLAQ13239 276 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF846Q147U1 533 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PTGR1Q14914 329 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 OXA1LQ15070 435 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC15A2Q16348 729 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SYPL1Q16563 259 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 GPR33Q49SQ1 333 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 BEX5Q5H9J7 111 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 AGBL2Q5U5Z8 902 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 UBE2UQ5VVX9 321 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 BSPRYQ5W0U4 402 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ASB18Q6ZVZ8 466 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC24A5Q71RS6 500 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CROCCP2Q86T23 111 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 KMT5CQ86Y97 462 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PGBD5Q8N414 524 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 STX19Q8N4C7 294 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM89BQ8N5H3 189 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CLDN19Q8N6F1 224 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 LRTM2Q8N967 370 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MFSD9Q8NBP5 474 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ACBD4Q8NC06 268 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM35BQ8NCS4 154 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 OR6X1Q8NH79 312 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ASB5Q8WWX0 329 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PIGCQ92535 297 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ELMO1Q92556 727 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 NR4A3Q92570 626 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC35C1Q96A29 364 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 IGSF21Q96ID5 467 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF479Q96JC4 524 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 C4orf45Q96LM5 186 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TGM7Q96PF1 710 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SERPINI1Q99574 410 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 IL12RB2Q99665 862 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 C2orf88Q9BSF0 95 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 DCTN5Q9BTE1 182 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 DNTTIP1Q9H147 329 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SPNS1Q9H2V7 528 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CPVLQ9H3G5 476 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM185BQ9H7F4 350 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZFP14Q9HCL3 533 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 HMG20AQ9NP66 347 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC52A3Q9NQ40 469 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 GDF3Q9NR23 364 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SEMA4GQ9NTN9 838 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZFP57Q9NU63 452 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MED17Q9NVC6 651 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 NLGN3Q9NZ94 848 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF224Q9NZL3 707 aa3.03□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms