RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	TIMP3	P35625	211 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPR4	P46093	362 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	HMGA2	P52926	109 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	IST1	P53990	364 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRKCD	Q05655	676 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	LAPTM4A	Q15012	233 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF74	Q16587	644 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR2A2	Q6IF42	318 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC43A2	Q8N370	569 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	KDM8	Q8N371	416 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR6S1	Q8NH40	331 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIGX	Q8TBF5	258 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYTIP	O60759	359 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAMP1	O60894	148 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR7A10	O76100	309 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCNB2	O95067	398 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	RCBTB2	O95199	551 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR6A2	O95222	327 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	FCGR1A	P12314	374 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAK	P20794	623 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	AHCY	P23526	432 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	IFNGR2	P38484	337 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	H3F3A	P84243	136 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR5J2	Q8NH18	312 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF128	Q8TEB7	428 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC120	Q96HB5	630 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	BDH2	Q9BUT1	245 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	FKRP	Q9H9S5	495 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF122	Q9H9V4	155 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHST11	Q9NPF2	352 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	POLE	Q07864	2286 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402		A0A0G2JNJ9	132 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	AQP7P3	A6NL99	342 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	C11orf98	E9PRG8	122 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	SERPINI2	O75830	405 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADORA3	P0DMS8	318 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	LIMS1	P48059	325 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARHGDIA	P52565	204 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTBP2	P56545	445 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	SIRPA	P78324	504 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	FOXF2	Q12947	444 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	MICA	Q29983	383 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	MTFR2	Q6P444	385 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	OAF	Q86UD1	273 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	NAXE	Q8NCW5	288 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	FUZ	Q9BT04	418 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402		Q9UFV3	132 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SELENBP1-208	ENST00000447402	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSPB2	A8KAH6	182 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF13	O43567	381 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGF2	P01344	180 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	POU2F1	P14859	743 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	OMP	P47874	163 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATP6AP1	Q15904	470 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSPB2	Q16082	182 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	LINC00471	Q8N535	108 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCAI	Q8N9R8	606 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR51A7	Q8NH64	312 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	GIPC3	Q8TF64	312 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SELENBP1-208	ENST00000447402	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.46

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