RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 VPS33AQ96AX1 596 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM19Q96HH6 336 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ITCHQ96J02 903 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 OR52B2Q96RD2 323 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNK17Q96T54 332 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 TAPBPLQ9BX59 468 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM45AQ9NWC5 275 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 CALML5Q9NZT1 146 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ZIM2Q9NZV7 527 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB21Q9UL25 225 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 CHST2Q9Y4C5 530 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 DSPPQ9NZW4 1301 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A0G2JPF8 293 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM247A6NEH6 219 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SLCO1B7G3V0H7 640 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 AHSA1O95433 338 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ZCCHC18P0CG32 403 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 TUBA1BP68363 451 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 TUBA4AP68366 448 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 VLDLRP98155 873 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 MST1LQ2TV78 715 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ATG16L1Q676U5 607 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 NIPAL3Q6P499 406 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 PODNL1Q6PEZ8 512 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 CREB3L2Q70SY1 520 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 TUBA1AQ71U36 451 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 LINGO2Q7L985 606 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 EPHX4Q8IUS5 362 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 KDM8Q8N371 416 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 MAL2Q969L2 176 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 C3orf49Q96BT1 292 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC25A36Q96CQ1 311 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 PIF1Q9H611 641 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 RMND5AQ9H871 391 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A096LPE4 126 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A096LPI6 279 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1W2PPZ6 126 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 NR5A2O00482 541 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 UBDO15205 165 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 NPIPB7O75200 414 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 UPK3AO75631 287 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 VAMP5O95183 116 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 CSF3P09919 207 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 PNMTP11086 282 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 USF1P22415 310 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 CARTPTQ16568 116 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ZSWIM7Q19AV6 140 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF311Q5JNZ3 666 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 MIER2Q8N344 545 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 STK35Q8TDR2 534 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC38A2Q96QD8 506 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNS3Q9BQ31 491 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ARMC7Q9H6L4 198 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 OBP2BQ9NPH6 170 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 RASD1Q9Y272 281 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ANK2Q01484 3957 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 OR6C65A6NJZ3 312 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 FTCDNL1E5RQL4 147 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 CLIC1O00299 241 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 CRYAAP02489 173 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 OR4A8P0C604 315 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM157CP0CG43 387 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SERPINF1P36955 418 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 PRSS12P56730 875 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 CLDN17P56750 224 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms