RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445304.1

RPL17P1-201, Transcript of ribosomal protein L17 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene RPL17P1, Length 536 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P1-201ENST00000445304 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.23□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 POMGNT2Q8NAT1 580 aa8.23□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 SLC38A4Q969I6 547 aa8.23□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 SLC47A1Q96FL8 570 aa8.23□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 MUS81Q96NY9 551 aa8.23□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 SH3GL1Q99961 368 aa8.23□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 PTDSS2Q9BVG9 487 aa8.23□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.23□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8.23□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 DLL4Q9NR61 685 aa8.23□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.23□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 SELENONQ9NZV5 590 aa8.23□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 ARID1AO14497 2285 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 A0A087WUJ7 227 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 A0A0B4J2E0 115 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 A0A1B0GX12 115 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 DPRXA6NFQ7 191 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 OR6C65A6NJZ3 312 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 FBP2O00757 339 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 SLC22A2O15244 555 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 CLOCKO15516 846 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 FMO6PO60774 539 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 LGI1O95970 557 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 PAX1P15863 534 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 MPGP29372 298 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 GUCY1A3Q02108 690 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 DMTNQ08495 405 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 SELPLGQ14242 412 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 MFSD13AQ14CX5 517 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 OR1Q1Q15612 314 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 GABRA6Q16445 453 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 DUSP7Q16829 419 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 MMEL1Q495T6 779 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 TSPO2Q5TGU0 170 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 CGB2Q6NT52 195 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 CREB3L2Q70SY1 520 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 AAED1Q7RTV5 226 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 P3H2Q8IVL5 708 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 SMYD1Q8NB12 490 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 OR8J3Q8NGG0 315 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 OR6S1Q8NH40 331 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 OR10A6Q8NH74 314 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 FBXW5Q969U6 566 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 SLC25A36Q96CQ1 311 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 BOD1Q96IK1 185 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 RADILQ96JH8 1075 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 GSX2Q9BZM3 304 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 CXorf56Q9H5V9 222 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 NANOGQ9H9S0 305 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 TMEM27Q9HBJ8 222 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 SAR1AQ9NR31 198 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.22□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.21□□□□□ -1.09
RPL17P1-201ENST00000445304 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 M0QX08 132 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 FXYD1O00168 92 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 AIM2O14862 343 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 TPST2O60704 377 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 ZNF43P17038 809 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 GZMMP51124 257 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 KLF10Q13118 480 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 NRF1Q16656 503 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 VMACQ2NL98 169 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 Q5PR19 223 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 REP15Q6BDI9 236 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 ZNF613Q6PF04 617 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 CCDC80Q76M96 950 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 EPHX4Q8IUS5 362 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 KBTBD8Q8NFY9 601 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 GPR32P1Q8NGA4 272 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 OR52N5Q8NH56 324 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 RASSF5Q8WWW0 418 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 TAAR8Q969N4 342 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 LRRC58Q96CX6 371 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 PERPQ96FX8 193 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 EPYCQ99645 322 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 ARHGDIGQ99819 225 aa8.21□□□□□ -1.1
RPL17P1-201ENST00000445304 TMEM43Q9BTV4 400 aa8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms