RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 REEP4Q9H6H4 257 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SGK2Q9HBY8 427 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 RHPN2P1A8MT19 583 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SAP18O00422 153 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 OIP5O43482 229 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ITGA10O75578 1167 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT33AO76009 404 aa7.74□□□□□ -1.17
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RABGEF1-203ENST00000439720 IL5P05113 134 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBG1P23258 451 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 AKR1C3P42330 323 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC6A12P48065 614 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 AP3S2P59780 193 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SEMG2Q02383 582 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CLINT1Q14677 625 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 PON3Q15166 354 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFA9Q16795 377 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 IER5LQ5T953 404 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC29A4Q7RTT9 530 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5J2Q8NH18 312 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 AKR7LQ8NHP1 331 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 BBS10Q8TAM1 723 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 PPCDCQ96CD2 204 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 GGACTQ9BVM4 153 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 JAM3Q9BX67 310 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 UCK1Q9HA47 277 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0C4DFX4 3053 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ANTXRLA6NF34 631 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 DBX1A6NMT0 343 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 GFYI3L273 518 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 FADS1O60427 444 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFB6O95139 128 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 FGF19O95750 216 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SAGP10523 405 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 EPXP11678 715 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 FOSL2P15408 326 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 LAP3P28838 519 aa7.74□□□□□ -1.17
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RABGEF1-203ENST00000439720 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM11AP58511 58 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SSX2Q16385 188 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CHST9Q7L1S5 443 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM99Q8N816 258 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 C14orf144Q96I85 54 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 IGSF21Q96ID5 467 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEH1Q9H213 219 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TAS2R10Q9NYW0 307 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TREM2Q9NZC2 230 aa7.74□□□□□ -1.17
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RABGEF1-203ENST00000439720 CRLS1Q9UJA2 301 aa7.74□□□□□ -1.17
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RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GX30 115 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SYT5O00445 386 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 PHYHO14832 338 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CTDSPLO15194 276 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 NARSO43776 548 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 HEXAP06865 529 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 OR8U8P0C7N1 319 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 GNSP15586 552 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 CR2P20023 1033 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP7.73□□□□□ -1.17
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