RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa12.16□□□□□ -0.46
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PRAME-209ENST00000439106 CORO2BQ9UQ03 480 aa12.16□□□□□ -0.46
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PRAME-209ENST00000439106 B3GAT1Q9P2W7 334 aa12.13□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 SLC13A4Q9UKG4 626 aa12.13□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 PRORSD1PA6NEY8 169 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 E7EQL1 145 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 M0QX08 132 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 FXYD1O00168 92 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 SERPINB7O75635 380 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 KRT33AO76009 404 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-209ENST00000439106 CD8AP01732 235 aa12.12□□□□□ -0.47
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