RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430976.5

PTPN4-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 5

Gene PTPN4, Length 4,154 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-203	ENST00000430976	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	CPVL	Q9H3G5	476 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	DDIT4	Q9NX09	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	IRF2	P14316	349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	ARSA	P15289	507 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	ACHE	P22303	614 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	GABRR1	P24046	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	CDKN1A	P38936	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	HSD11B2	P80365	405 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	BLID	Q8IZY5	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	ZNF738	Q8NE65	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	DNASE1L2	Q92874	299 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	SEH1L	Q96EE3	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	IMPA2	O14732	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	FABP7	O15540	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	SELENOF	O60613	162 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	BANF1	O75531	89 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	PRSS23	O95084	383 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	BRI3	O95415	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	EFEMP2	O95967	443 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	INHBB	P09529	407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	MGMT	P16455	207 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	EPHA1	P21709	976 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	PSMB10	P40306	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	DOC2B	Q14184	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	CCL15	Q16663	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	DCAF10	Q5QP82	559 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	C1orf189	Q5VU69	101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	ZNF787	Q6DD87	383 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	LYG2	Q86SG7	212 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	NUBPL	Q8TB37	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	CPB2	Q96IY4	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	TRIB3	Q96RU7	358 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN4-203	ENST00000430976	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms