RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAPBPLQ9BX59 468 aa11.44□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NELFAQ9H3P2 528 aa11.44□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC61A2Q9H9S3 476 aa11.44□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADPRHL2Q9NX46 363 aa11.44□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTNL2Q9UIR0 455 aa11.44□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6C65A6NJZ3 312 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR5A2O00482 541 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCF21O43680 179 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TYROBPO43914 113 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VAMP5O95183 116 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV1-44P01699 117 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYZAPP0CAP1 466 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GIFP27352 417 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 S100A3P33764 101 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHN2P52757 468 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSWIM7Q19AV6 140 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM225Q6GV28 225 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NIPAL3Q6P499 406 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD16Q6P6B7 361 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CREB3L2Q70SY1 520 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUP37Q8NFH4 326 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4F15Q8NGB8 312 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF442Q9H7R0 627 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RLIMQ9NVW2 624 aa11.43□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A096LPE4 126 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PPZ6 126 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDHR4A6H8M9 788 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC154A6NI56 674 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A8MVM7 634 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 hCG_2039718K7EN88 272 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UPK3AO75631 287 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV3-15P01624 115 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINE1P05121 402 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TACSTD2P09758 323 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GKN3PP0CG01 181 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR2F1P10589 423 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DAOP14920 347 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LBPP18428 481 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL2RGP31785 369 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDKN2CP42773 168 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFFO1Q0D2I5 559 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BNIP2Q12982 314 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIN52Q52LA3 116 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WBP2NLQ6ICG8 309 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF836Q6ZNA1 936 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPHX4Q8IUS5 362 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PEX5LQ8IYB4 626 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC34Q8IZ02 419 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CADM2Q8N3J6 435 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM169BQ8N8A8 192 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPS1Q92902 700 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf159Q96HA4 380 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PANX1Q96RD7 426 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAP2CQ9Y3L5 183 aa11.42□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DSPPQ9NZW4 1301 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR91A4D1P6 747 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LILRA1O75019 489 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CELA3BP08861 270 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGA2P17301 1181 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPR2P20594 1047 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APEX1P27695 318 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRP14P37108 136 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NME5P56597 212 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COPZ1P61923 177 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HGFACQ04756 655 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHI3L2Q15782 390 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX20Q5RI15 118 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf140Q5VVS0 124 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HDXQ7Z353 690 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VRK2Q86Y07 508 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SVOPLQ8N434 492 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC01356Q8N9X3 169 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEX37Q96LM6 180 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUF2Q9BZD4 464 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00470Q9BZP3 86 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C20orf27Q9GZN8 174 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRDM4Q9UKN5 801 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASD1Q9Y272 281 aa11.41□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A096LPI6 279 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPIPB7O75200 414 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSNP06396 782 aa11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms