RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS45Q7RTY3 260 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GALNT11Q8NCW6 608 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51A4Q8NGJ6 313 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GPX8Q8TED1 209 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FOPNLQ96NB1 174 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 BRD7Q9NPI1 651 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LRFN2Q9ULH4 789 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ANAPC10Q9UM13 185 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR45Q9Y484 360 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HRH3Q9Y5N1 445 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MSTNO14793 375 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGEF9O43307 516 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PNPP00491 289 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GKN3PP0CG01 181 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PTNP21246 168 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GJA4P35212 333 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DLX5P56178 289 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ROM1Q03395 351 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAM15Q13444 863 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF697Q5TEC3 545 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CEACAM19Q7Z692 300 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DTX3Q8N9I9 347 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C4orf36Q96KX1 117 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C12orf66Q96MD2 445 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LMF1Q96S06 567 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV27A0A087WT01 109 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A087WUJ7 227 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1B0GTH9 108 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PMS2P1A4D2B8 440 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 UNC119BA6NIH7 251 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FGF16O43320 207 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RLN2P04090 185 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
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PGGT1B-203ENST00000419445 SOAT1P35610 550 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM34P42696 430 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TCTE1Q5JU00 501 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL9Q6T311 187 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF44Q7L0R7 432 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NAXDQ8IW45 347 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC43A2Q8N370 569 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5M1Q8NGP8 315 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR13C8Q8NGS7 320 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX47Q8TBZ9 253 aa3.3□□□□□ -1.88
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PGGT1B-203ENST00000419445 MIB2Q96AX9 1013 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ART5Q96L15 291 aa3.3□□□□□ -1.88
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PGGT1B-203ENST00000419445 SLC38A2Q96QD8 506 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CITED4Q96RK1 184 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM100Q9NV29 134 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GDE1Q9NZC3 331 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNK6Q9Y257 313 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GABARAPH6UMI1 98 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 AGRPO00253 132 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HPP00738 406 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKAR1AP10644 381 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RAD52P43351 418 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR1P46091 355 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CD226Q15762 336 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF615Q8N8J6 731 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CDRT4Q8N9R6 151 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 BVESQ8NE79 360 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RSC1A1Q92681 617 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 POT1Q9NUX5 634 aa3.3□□□□□ -1.88
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PGGT1B-203ENST00000419445 FBLN5Q9UBX5 448 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A13Q9UJS0 675 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ITGA5P08648 1049 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GIPP09681 153 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2T7P0C7T2 308 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ADH5P11766 374 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP2R1BP30154 601 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CAPZA2P47755 286 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SCAND1P57086 179 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM196Q5HYL7 178 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FAAP20Q6NZ36 180 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2T27Q8NH04 317 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C8orf44Q96CB5 159 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
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