RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 CBLP22681 906 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC7A2P52569 658 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 CASP12Q6UXS9 341 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 CREB3L2Q70SY1 520 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 AAED1Q7RTV5 226 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 KDM8Q8N371 416 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM45BQ96B21 275 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 EPYCQ99645 322 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 ASB6Q9NWX5 421 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 EDARQ9UNE0 448 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 POLQO75417 2590 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 ENO4A6NNW6 628 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 NME4O00746 187 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 THY1P04216 161 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 LTBQ06643 244 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 FAPQ12884 760 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 CYBRD1Q53TN4 286 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 CARM1Q86X55 608 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 EPHX4Q8IUS5 362 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 OR6S1Q8NH40 331 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM43Q9BTV4 400 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHAC1Q9H158 963 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 UPB1Q9UBR1 384 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 SEC14L4Q9UDX3 406 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAPPC13A5PLN9 417 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 M0R082 166 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 NDUFAB1O14561 156 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 CHP2O43745 196 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 FZD7O75084 574 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 LYPD3O95274 346 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFRSF1BP20333 461 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 COX5AP20674 150 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 PTNP21246 168 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 GRPRP30550 384 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 PSME3P61289 254 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 SELENOWP63302 87 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 TAB1Q15750 504 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 BEX5Q5H9J7 111 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 TSPO2Q5TGU0 170 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF417Q8TAU3 575 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 OXGR1Q96P68 337 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC37BQ96QE4 947 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 CCT8L2Q96SF2 557 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC7A10Q9NS82 523 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC7A7Q9UM01 511 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 CIB4A0PJX0 185 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 GSTA4O15217 222 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 BGLAPP02818 100 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 GGT1P19440 569 aa18.61■□□□□ 0.57
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SH3BP4-204ENST00000416021 OR1E2P47887 323 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 IST1P53990 364 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 MFSD13AQ14CX5 517 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR88Q6ZMY6 472 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 C10orf53Q8N6V4 93 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 NINJ1Q92982 152 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 TPD52L3Q96J77 140 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 HS3ST6Q96QI5 342 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 ALG2Q9H553 416 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 MALT1Q9UDY8 824 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 SPG11Q96JI7 2443 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 MS4A18H0YCH9 400 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 CXCR6O00574 342 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF43P17038 809 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 DNASE1P24855 282 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 GSK3BP49841 420 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 C1DQ13901 141 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 STK11Q15831 433 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 MS4A18Q3C1V0 323 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 P2RY8Q86VZ1 359 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 PLPPR2Q96GM1 343 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC41A3Q96GZ6 507 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 MPP4Q96JB8 637 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 TAS2R16Q9NYV7 291 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 CORINQ9Y5Q5 1042 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRN3E7EW58 273 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 PDLIM1O00151 329 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 DCTN3O75935 186 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 SELENOPP49908 381 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 NR1H2P55055 460 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 IL1RL1Q01638 556 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 TIMM23BQ5SRD1 257 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 NIPAL3Q6P499 406 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4-204ENST00000416021 DEF8Q6ZN54 512 aa18.59■□□□□ 0.57
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