RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 LIPT2A6NK58 231 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 MCIDASD6RGH6 385 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 CLPTM1O96005 669 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 SMIM18P0DKX4 95 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 MYBPHQ13203 477 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 EMC4Q5J8M3 183 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF773Q6PK81 442 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 OR5M1Q8NGP8 315 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ARL5BQ96KC2 179 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 DUSP21Q9H596 190 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 AASSQ9UDR5 926 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 TRAV17A0A0B4J275 112 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 PINLYPA6NC86 204 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 EFCAB10A6NFE3 127 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 PRODHO43272 600 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 XPNPEP2O43895 674 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 TRAPPC6AO75865 159 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 HPNP05981 417 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 IL11P20809 199 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 PAICSP22234 425 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 MEOX1P50221 254 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC35A2P78381 396 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 PLGLB1Q02325 96 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 OR7A5Q15622 319 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 GPR139Q6DWJ6 353 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 GID4Q8IVV7 300 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 LRRC75AQ8NAA5 344 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 MOSPD2Q8NHP6 518 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 MYDGFQ969H8 173 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 KATNB1Q9BVA0 655 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 HES7Q9BYE0 225 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 TTTY12Q9BZ98 90 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 VCX3AQ9NNX9 186 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 CLCA1A8K7I4 914 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 M0R082 166 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ACOT7O00154 380 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ENTPD6O75354 484 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ADRB1P08588 477 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 RFPL3SP0C7P2 107 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 UCNP55089 124 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 NXNL2Q5VZ03 156 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC22A16Q86VW1 577 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF417Q8TAU3 575 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 SFXN2Q96NB2 322 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 OR5B2Q96R09 309 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 CHST11Q9NPF2 352 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 SNX5Q9Y5X3 404 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 MED13Q9UHV7 2174 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 IRGMA1A4Y4 181 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 TRIM64CA6NLI5 447 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 PTGES3LE9PB15 166 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 PLPP3O14495 311 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 GLSO94925 669 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 PMS2P2O95744 297 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ADORA3P0DMS8 318 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 IMPDH2P12268 514 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 PIPP12273 146 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 CTXN1P60606 82 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC35A1P78382 337 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ZP4Q12836 540 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ANKK1Q8NFD2 765 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 MIB2Q96AX9 1013 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM185BQ9H7F4 350 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 INIPQ9NRY2 104 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 PCNX3Q9H6A9 2034 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 RNF13O43567 381 aa22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 TXNDC12O95881 172 aa22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 ATP6V1B1P15313 513 aa22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 SDHAP31040 664 aa22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 SFTPDP35247 375 aa22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 B3GALT5-AS1P59052 145 aa22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 GXYLT1Q4G148 440 aa22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3-201ENST00000379215 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms