RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP6AP1Q15904 470 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 DPYSL2Q16555 572 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 MICBQ29980 383 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 BOLA3Q53S33 107 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CARD16Q5EG05 197 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 OR52E8Q6IFG1 317 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 KDELC1Q6UW63 502 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 HSDL2Q6YN16 418 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC26A11Q86WA9 606 aa2.4□□□□□ -2.03
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RABGGTB-202ENST00000370826 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa2.39□□□□□ -2.03
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RABGGTB-202ENST00000370826 ATP5LO75964 103 aa2.39□□□□□ -2.03
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RABGGTB-202ENST00000370826 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
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RABGGTB-202ENST00000370826 Q6ZN92 141 aa2.39□□□□□ -2.03
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RABGGTB-202ENST00000370826 ACTR6Q9GZN1 396 aa2.39□□□□□ -2.03
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RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD63C9JTQ0 380 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PES1O00541 588 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 MAGEB3O15480 346 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SNAI2O43623 268 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 TDGF1P13385 188 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 POU2F1P14859 743 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF44P15621 663 aa2.38□□□□□ -2.03
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RABGGTB-202ENST00000370826 PEX19P40855 299 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 TDGF1P3P51864 188 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SFT2D3Q587I9 215 aa2.38□□□□□ -2.03
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RABGGTB-202ENST00000370826 DMRTC1Q5HYR2 192 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF620Q6ZNG0 422 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF621Q6ZSS3 439 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 NLRP9Q7RTR0 991 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM158Q8WZ71 300 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM246Q9BRR3 403 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa2.38□□□□□ -2.03
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RABGGTB-202ENST00000370826 QPCTLQ9NXS2 382 aa2.38□□□□□ -2.03
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RABGGTB-202ENST00000370826 SEC14L3Q9UDX4 400 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ASTN1O14525 1302 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PDS5BQ9NTI5 1447 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 A8MXQ7 604 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 RSPH10B2B2RC85 870 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 LAD1O00515 517 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
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