RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 OR10A4Q9H209 315 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 SELENONQ9NZV5 590 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 SH3GLB1Q9Y371 365 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC168Q8NDH2 2452 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 LRRN3E7EW58 273 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 M0R082 166 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 KLF4O43474 513 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 CHP2O43745 196 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 BGLAPP02818 100 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 PPP3CBP16298 524 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 GRPRP30550 384 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 OR1E2P47887 323 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 PSME3P61289 254 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 P2RY6Q15077 328 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 CYBRD1Q53TN4 286 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 TSPO2Q5TGU0 170 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 FBXW9Q5XUX1 488 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ALKBH2Q6NS38 261 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 C5orf46Q6UWT4 87 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 LINC00114Q6XXX2 140 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 WFDC8Q8IUA0 241 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 STEAP2Q8NFT2 490 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF417Q8TAU3 575 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 PROX1Q92786 737 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM45BQ96B21 275 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 PCDHAC1Q9H158 963 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ALG2Q9H553 416 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 B3GAT1Q9P2W7 334 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ABCD2Q9UBJ2 740 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 SLC7A7Q9UM01 511 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 MYO9AB2RTY4 2548 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 TRAPPC13A5PLN9 417 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 FAPQ12884 760 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 TAB1Q15750 504 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM225Q6GV28 225 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 DEF8Q6ZN54 512 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 CREB3L2Q70SY1 520 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 EPHX4Q8IUS5 362 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 UBE2J2Q8N2K1 259 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 MOGAT1Q96PD6 335 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM43Q9BTV4 400 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 HDHD5Q9BXW7 423 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 SLC7A10Q9NS82 523 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ARL8BQ9NVJ2 186 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 FAM53CQ9NYF3 392 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 MALT1Q9UDY8 824 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 BAG5Q9UL15 447 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 RASD1Q9Y272 281 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 AP3M1Q9Y2T2 418 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 PDLIM1O00151 329 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 CXCR6O00574 342 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 OR2T1O43869 369 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 RAD51DO75771 328 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 VAMP5O95183 116 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ITGA5P08648 1049 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 SELENOPP49908 381 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 LGALS3BPQ08380 585 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 STK11Q15831 433 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 C9orf135Q5VTT2 229 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 AAED1Q7RTV5 226 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 VTCN1Q7Z7D3 282 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 OR6S1Q8NH40 331 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 SLC41A3Q96GZ6 507 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 TPD52L3Q96J77 140 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 CCT8L2Q96SF2 557 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 EPYCQ99645 322 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 PRSS27Q9BQR3 290 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ASB6Q9NWX5 421 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 HPRP00739 348 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 IFNA14P01570 189 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 NCK1P16333 377 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 FUT4P22083 530 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 IST1P53990 364 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 SELENOWP63302 87 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 BEX5Q5H9J7 111 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 NIPAL3Q6P499 406 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 PAMR1Q6UXH9 720 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 NKAIN4Q8IVV8 208 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 PLPPR2Q96GM1 343 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 LRRC37BQ96QE4 947 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF426Q9BUY5 554 aa13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms