RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 FOXK2Q01167 660 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 TATDN3Q17R31 274 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 MOB3CQ70IA8 216 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 DPY19L4Q7Z388 723 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 SLC43A2Q8N370 569 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 CLDN22Q8N7P3 220 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 OR7G1Q8NGA0 311 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM106AQ96A25 262 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 PRDM9Q9NQV7 894 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 RLIMQ9NVW2 624 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 FZD7O75084 574 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 MAKP20794 623 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 COMMD7Q86VX2 200 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 PM20D2Q8IYS1 436 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 FRMD1Q8N878 549 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 OR4M1Q8NGD0 313 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 IL1F10Q8WWZ1 152 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 NIPAL2Q9H841 368 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 TMED7Q9Y3B3 224 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 TK1P04183 234 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 ETV5P41161 510 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 B3GLCTQ6Y288 498 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 OR7G2Q8NG99 324 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 OR13C9Q8NGT0 318 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 ZFPM2Q8WW38 1151 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 OR1E3Q8WZA6 343 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 S100PBPQ96BU1 408 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 NMNAT3Q96T66 252 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 METTL9Q9H1A3 318 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 ASF1BQ9NVP2 202 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 LUMP51884 338 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 OR56B4Q8NH76 319 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 HTR1FP30939 366 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 EIF1P41567 113 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 Q499Y3 187 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF529Q6P280 563 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF585AQ6P3V2 769 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 GDF7Q7Z4P5 450 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 ACBD4Q8NC06 268 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 SLC37A2Q8TED4 501 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 PDXPQ96GD0 296 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 TEX37Q96LM6 180 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV3-25P01717 112 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 TPT1P13693 172 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 PRKACBP22694 351 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 DPP4P27487 766 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 TPMTP51580 245 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 SLX4IPQ5VYV7 408 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM64Q6YI46 380 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 ENTHD1Q8IYW4 607 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 GAB3Q8WWW8 586 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 WDR76Q9H967 626 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 LYRM4Q9HD34 91 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 NRIP3Q9NQ35 241 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 CLDN17P56750 224 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 PLGLAQ15195 96 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 LRFN1Q9P244 771 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 CAMK2AQ9UQM7 478 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 H7C1C5 153 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 GFYI3L273 518 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 LCN6P62502 163 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2NLQ5JXB2 153 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 APOOLQ6UXV4 268 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 OR56B1Q8NGI3 324 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 OBP2BQ9NPH6 170 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 PADI1Q9ULC6 663 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTSL3P82987 1691 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 D6RAR5 112 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 TAS2R46P59540 309 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 DPTQ07507 201 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 SLC6A18Q96N87 628 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 NOX4Q9NPH5 578 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP22Q9NRW4 184 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 EHFQ9NZC4 300 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-203ENST00000366687 LRIT2A6NDA9 550 aa18.77■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 LPLP06858 475 aa18.77■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 IL2RGP31785 369 aa18.77■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 MFAP5Q13361 173 aa18.77■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PSMF1Q92530 271 aa18.77■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 MUCL1Q96DR8 90 aa18.77■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TARM1B6A8C7 271 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 GPR137BO60478 399 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 RRADP55042 308 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 CAV3P56539 151 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 RAP2BP61225 183 aa18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms