RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 ACTA2P62736 377 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 ACTG2P63267 376 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 POU4F2Q12837 409 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 CCL14Q16627 93 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 SFXN5Q8TD22 340 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 A0A1B0GTI1 187 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 RDH16O75452 317 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 PMS2P2O95744 297 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 CD79AP11912 226 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 ZNF44P15621 663 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 EDNRAP25101 427 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 ITPKBP27987 946 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 MPIP34949 423 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 CXADRP78310 365 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 WDR88Q6ZMY6 472 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 UBE3DQ7Z6J8 389 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 NAA40Q86UY6 237 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 EXO5Q9H790 373 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 FKRPQ9H9S5 495 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 UQCC1Q9NVA1 299 aa19.97■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 RIIAD1A6NNX1 92 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 GPRIN2O60269 458 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 FCMRO60667 390 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 PAX6P26367 422 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 MAGEB1P43366 347 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 CENPAP49450 140 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 RNF212Q495C1 297 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 LIN54Q6MZP7 749 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 ARL14Q8N4G2 192 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 OR5M8Q8NGP6 311 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 PFN4Q8NHR9 129 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 ARL11Q969Q4 196 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 ARMC5Q96C12 935 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 IL17FQ96PD4 163 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 ETV7Q9Y603 341 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 TTLL8A6PVC2 850 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 H7BY64 318 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 FADS1O60427 444 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 RCBTB2O95199 551 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 C22orf39Q6P5X5 142 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 LCTLQ6UWM7 567 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 GAREM2Q75VX8 874 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 CXorf40AQ8TE69 158 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 EDAQ92838 391 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 GLYATL1Q969I3 302 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 TMEM100Q9NV29 134 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 DENND4CQ5VZ89 1909 aa19.96■□□□□ 0.79
OPN3-201ENST00000366554 PAPLNO95428 1278 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 ITGB2P05107 769 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 OR4E1P0C645 316 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 ABCD3P28288 659 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 STEAP2Q8NFT2 490 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 SGK3Q96BR1 496 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 SLC22A12Q96S37 553 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 POFUT1Q9H488 388 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 CLDND1Q9NY35 253 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 NUDT19A8MXV4 375 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 XRCC3O43542 346 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 MELTFP08582 738 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 OR2T7P0C7T2 308 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 DLSTP36957 453 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 Q6ZNB5 142 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 SDR9C7Q8NEX9 313 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 OR2T27Q8NH04 317 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 MARCH5Q9NX47 278 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 SIGLEC7Q9Y286 467 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa19.95■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 LRRC72A6NJI9 287 aa19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 C1orf196B1AJZ1 125 aa19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 EPCAMP16422 314 aa19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 NTSP30990 170 aa19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 CASRP41180 1078 aa19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 ACER2Q5QJU3 275 aa19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 C2orf42Q9NWW7 574 aa19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 CALML5Q9NZT1 146 aa19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 GNG8Q9UK08 70 aa19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 GLOD5A6NK44 160 aa19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 F5H0A9 414 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 ST8SIA5O15466 376 aa19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 POP4O95707 220 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 GKN3PP0CG01 181 aa19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 AKAIN1P0CW23 69 aa19.94■□□□□ 0.78
OPN3-201ENST00000366554 ZNF3P17036 446 aa19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms