RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC36A2Q495M3 483 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 HACD4Q5VWC8 232 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 LILRA6Q6PI73 481 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CFAP77Q6ZQR2 320 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 LILRA2Q8N149 483 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4M2Q8NGB6 313 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 IFI44Q8TCB0 444 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM68Q96MH6 324 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OBP2BQ9NPH6 170 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SSC5DA1L4H1 1573 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 IFNA1P01562 189 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NID1P14543 1247 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ST6GAL1P15907 406 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GAB1Q13480 694 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OR1J2Q8NGS2 313 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 UCN3Q969E3 161 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PKMYT1Q99640 499 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR76Q9H967 626 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TAS2R3Q9NYW6 316 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 A6NHS1 94 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GABRPO00591 440 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 LPLP06858 475 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 BIDP55957 195 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SIRPAP78324 504 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 C9orf135Q5VTT2 229 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM255BQ8WV15 326 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB39BQ96DA2 213 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NMNAT3Q96T66 252 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM165Q9HC07 324 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 HMX3A6NHT5 357 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 H0YIG0 161 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CD22P20273 847 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PRKACBP22694 351 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 DLEU7Q6UYE1 221 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MOB3CQ70IA8 216 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC35D2Q76EJ3 337 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFAF7Q7L592 441 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SERPINA12Q8IW75 414 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CD300LFQ8TDQ1 290 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 IP6K3Q96PC2 410 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX101Q9BY14 249 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 STRCQ7RTU9 1775 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 IDSB3KWA1 339 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 DVL2O14641 736 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC22A5O76082 557 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CTSLP07711 333 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GABRR1P24046 479 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 HTR2AP28223 471 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SAXO2Q658L1 398 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF836Q6ZNA1 936 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF695Q8IW36 515 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 H7C1C5 153 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CEACAM5P06731 702 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 THBS1P07996 1170 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CTGFP29279 349 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 LCN6P62502 163 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MFAP5Q13361 173 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 RHEBQ15382 184 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CYHR1Q6ZMK1 362 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MARCH3Q86UD3 253 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GIMAP5Q96F15 307 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM246Q9BRR3 403 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MED20Q9H944 212 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NOTOA8MTQ0 251 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC16A6O15403 523 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 DPY19L4Q7Z388 723 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 KMT5CQ86Y97 462 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2T35Q8NGX2 323 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NICN1Q9BSH3 213 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NRSN2Q9GZP1 204 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 LTB4R2Q9NPC1 389 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 HTR1FP30939 366 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf140Q5VVS0 124 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE2UQ5VVX9 321 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TSSK4Q6SA08 328 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 LHX6Q9UPM6 363 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TMPRSS11DO60235 418 aa15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GLB1P16278 677 aa15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf53Q5VUE5 145 aa15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SLX4IPQ5VYV7 408 aa15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC18Q8N456 261 aa15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PCED1AQ9H1Q7 454 aa15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms