RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 RIPK3Q9Y572 518 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 A0A1W2PPH5 198 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 POM121CA8CG34 1229 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 CST2P09228 141 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 CPEP16870 476 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 GRB2P62993 217 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
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PTPRB-202ENST00000334414 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
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PTPRB-202ENST00000334414 K7ERU9 68 aa5.15□□□□□ -1.59
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PTPRB-202ENST00000334414 SRMP19623 302 aa5.15□□□□□ -1.59
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PTPRB-202ENST00000334414 CEBPEQ15744 281 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 PLA1AQ53H76 456 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 ELFN2Q5R3F8 820 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 SHDQ96IW2 340 aa5.15□□□□□ -1.59
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PTPRB-202ENST00000334414 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 CDH20Q9HBT6 801 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 DMRT3Q9NQL9 472 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 GPR160Q9UJ42 338 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRB-202ENST00000334414 GPR34Q9UPC5 381 aa5.15□□□□□ -1.59
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