RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 BHLHE40O14503 412 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 FCER1GP30273 86 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 HMGCLP35914 325 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 MARCH3Q86UD3 253 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 PIANPQ8IYJ0 282 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 IFI44Q8TCB0 444 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 CD300AQ9UGN4 299 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 STYXL1Q9Y6J8 313 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 ENPP4Q9Y6X5 453 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 ARHGEF15O94989 841 aa9.83□□□□□ -0.84
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CLN8-201ENST00000331222 NPY5RQ15761 445 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 TAZQ16635 292 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 OTPQ5XKR4 325 aa9.83□□□□□ -0.84
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CLN8-201ENST00000331222 EDAQ92838 391 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 TECTBQ96PL2 329 aa9.83□□□□□ -0.84
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CLN8-201ENST00000331222 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 GHRLQ9UBU3 117 aa9.83□□□□□ -0.84
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CLN8-201ENST00000331222 ENPP1P22413 925 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 FAM111BQ6SJ93 734 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 GIMAP1Q8WWP7 306 aa9.83□□□□□ -0.84
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CLN8-201ENST00000331222 RANBP9Q96S59 729 aa9.83□□□□□ -0.84
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CLN8-201ENST00000331222 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 A0A096LPE4 126 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 A0A1W2PPZ6 126 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 TMEM72A0PK05 275 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 ZNF749O43361 778 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 RAB39BQ96DA2 213 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 ZNF286AQ9HBT8 521 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 DESI1Q6ICB0 168 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 ZNF813Q6ZN06 617 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 ABHD4Q8TB40 342 aa9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 A0A1W2PS29 197 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 ZNF587BE7ETH6 402 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 SMLR1H3BR10 107 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 C1SP09871 688 aa9.82□□□□□ -0.84
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CLN8-201ENST00000331222 FABP6P51161 128 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 INHBCP55103 352 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 ZNF92Q03936 586 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.82□□□□□ -0.84
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CLN8-201ENST00000331222 SLC41A2Q96JW4 573 aa9.82□□□□□ -0.84
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CLN8-201ENST00000331222 TCAPO15273 167 aa9.82□□□□□ -0.84
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CLN8-201ENST00000331222 PRPH2P23942 346 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 PCBD1P61457 104 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 CDK5R2Q13319 367 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 KIR2DS3Q14952 304 aa9.82□□□□□ -0.84
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CLN8-201ENST00000331222 NMES1Q9C002 83 aa9.82□□□□□ -0.84
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CLN8-201ENST00000331222 NKX6-3A6NJ46 265 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 OR6C65A6NJZ3 312 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 AQP7P3A6NL99 342 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 PPP6CO00743 305 aa9.82□□□□□ -0.84
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CLN8-201ENST00000331222 LYRM1O43325 122 aa9.82□□□□□ -0.84
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CLN8-201ENST00000331222 FAM157BP0CG42 384 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 GLI4P10075 376 aa9.82□□□□□ -0.84
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CLN8-201ENST00000331222 OPRL1P41146 370 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 HSD17B7P56937 341 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 RPE65Q16518 533 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 TMIGD2Q96BF3 282 aa9.82□□□□□ -0.84
CLN8-201ENST00000331222 EMC6Q9BV81 110 aa9.82□□□□□ -0.84
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