RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 NR1H2P55055 460 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDH12P55289 794 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 VEZF1Q14119 521 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 KEAP1Q14145 624 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM69AQ5T7M9 428 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERICH5Q6P6B1 374 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM204Q9BSN7 226 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBTD1Q9HAC8 227 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARPBPQ9NWS1 579 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASB6Q9NWX5 421 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 SELENONQ9NZV5 590 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASD1Q9Y272 281 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCT8L1PA6NM43 557 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAD51DO75771 328 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 GGT1P19440 569 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTNP21246 168 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 DRD4P21917 467 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 LSP1P33241 339 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAPQ12884 760 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 STK11Q15831 433 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENTPD8Q5MY95 495 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPO2Q5TGU0 170 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM225Q6GV28 225 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF613Q6PF04 617 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPHX4Q8IUS5 362 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF217Q8TC41 542 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC26A7Q8TE54 656 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALPK1Q96QP1 1244 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM107BQ9H098 131 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYLK2Q9H1R3 596 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC7A10Q9NS82 523 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 CMTM6Q9NX76 183 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R16Q9NYV7 291 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 B3GAT1Q9P2W7 334 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 DSCAMO60469 2012 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 M0R082 166 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2T1O43869 369 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYPD3O95274 346 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLAUP00749 431 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 THY1P04216 161 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRPRP30550 384 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 GYS2P54840 703 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPA1Q15181 289 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFB113Q30KQ7 82 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIMM23BQ5SRD1 257 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR88Q6ZMY6 472 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 CREB3L2Q70SY1 520 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 AAED1Q7RTV5 226 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2T12Q8NG77 320 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF417Q8TAU3 575 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASSF5Q8WWW0 418 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM43Q9BTV4 400 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHAC1Q9H158 963 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5H1A6NKK0 313 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 AIM2O14862 343 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHP2O43745 196 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX3O60493 162 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 BGLAPP02818 100 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 SELENOPP49908 381 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 LTBQ06643 244 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACKR1Q16570 336 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCMAPQ5T1S8 102 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00114Q6XXX2 140 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARPINQ7Z6K5 226 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDM8Q8N371 416 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6S1Q8NH40 331 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPYCQ99645 322 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPAP1Q9NZP6 1156 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 UPB1Q9UBR1 384 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED13LQ71F56 2210 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 CIB4A0PJX0 185 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFRSF1BP20333 461 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBLP22681 906 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABRA6Q16445 453 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9orf135Q5VTT2 229 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 C20orf204Q6ZNR8 217 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 P2RY8Q86VZ1 359 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 CARM1Q86X55 608 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC15A3Q8IY34 581 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 MICU2Q8IYU8 434 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 POMGNT2Q8NAT1 580 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 PROX1Q92786 737 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC41A3Q96GZ6 507 aa17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms