RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 SLC35F3Q8IY50 421 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 TOMM5Q8N4H5 51 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 TTTY10Q9BZA0 68 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 NANSQ9NR45 359 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ACOXLQ9NUZ1 547 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 MCUBQ9NWR8 336 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 CTDSPLO15194 276 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SELENOFO60613 162 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 TACSTD2P09758 323 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 EFR3AQ14156 821 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 KRT74Q7RTS7 529 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 OR5H6Q8NGV6 325 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 RASD2Q96D21 266 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 OR14A2Q96R54 314 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ALG12Q9BV10 488 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 C12orf10Q9HB07 376 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 RXFP3Q9NSD7 469 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 COPS3Q9UNS2 423 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF281Q9Y2X9 895 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 LCN1P31025 176 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SKP2Q13309 424 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SLC36A2Q495M3 483 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 EMC4Q5J8M3 183 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 LEG1Q6P5S2 330 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 YIPF5Q969M3 257 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ARPC5LQ9BPX5 153 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 MRI1Q9BV20 369 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 GMEB2Q9UKD1 530 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 BOLA1Q9Y3E2 137 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 OR2W5A6NFC9 320 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF264O43296 627 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 TXNDC12O95881 172 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SRMP19623 302 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 RORAP35398 523 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 UBE2NLQ5JXB2 153 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SLC16A9Q7RTY1 509 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 C10orf53Q8N6V4 93 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 MOSPD2Q8NHP6 518 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF671Q8TAW3 534 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 LMX1AQ8TE12 382 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 RAB33BQ9H082 229 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 PLSCR3Q9NRY6 295 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1B0GVC2 190 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1W2PPK0 400 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 A6NIN4 97 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM150CB9EJG8 249 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 CD27P26842 260 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SDHAP31040 664 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 BTCP35070 178 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SLC37A1P57057 533 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 RACK1P63244 317 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ALG10Q5BKT4 473 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 LINC01590Q5TEZ4 76 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 FAM122BQ7Z309 247 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 TSTD1Q8NFU3 115 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ZNRF4Q8WWF5 429 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ZDHHC12Q96GR4 267 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 TGM7Q96PF1 710 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 OR1F2PQ96R84 312 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 GALNT9Q9HCQ5 603 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa17.85■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 C7orf66A4D0T2 115 aa17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 AGRPO00253 132 aa17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 CD38P28907 300 aa17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 AQP2P41181 271 aa17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SLC6A8P48029 635 aa17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 RAG2P55895 527 aa17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF684Q5T5D7 378 aa17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SLC22A10Q63ZE4 541 aa17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 FAM220AQ7Z4H9 259 aa17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 DTX3Q8N9I9 347 aa17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC75AQ8NAA5 344 aa17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 Q96M85 177 aa17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 MMP25Q9NPA2 562 aa17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 FRG2CA6NGY1 282 aa17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 UTS2O95399 124 aa17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ASAH2BP0C7U1 165 aa17.84■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms