RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303230.5

HCN1-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN1, Length 9,885 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-201ENST00000303230 SLC39A9Q9NUM3 307 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 UMAD1C9J7I0 102 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 EPHA1P21709 976 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 AHRP35869 848 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 SLC22A24Q8N4F4 322 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 ALKBH4Q9NXW9 302 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 PLAGL1Q9UM63 463 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 M0R3H8 397 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 SRMP19623 302 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 GRM7Q14831 915 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 KIR2DS3Q14952 304 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 TMEM18Q96B42 140 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 CD63P08962 238 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 TSFMP43897 325 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 EMP2P54851 167 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 IQCJQ1A5X6 159 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 CLEC14AQ86T13 490 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 EGLN3Q9H6Z9 239 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 SLC6A20Q9NP91 592 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 A0A1W2PRU2 124 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 ZNF44P15621 663 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 TNFSF4P23510 183 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 ADPRMQ3LIE5 342 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 CHRDQ9H2X0 955 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 POU2F3Q9UKI9 436 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 ARAFP10398 606 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 PTAFRP25105 342 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 FAM58AQ8N1B3 248 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 SHANK1Q9Y566 2161 aa15.8■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 PHYHD1Q5SRE7 291 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 ETV5P41161 510 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 BAMBIQ13145 260 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 LRP10Q7Z4F1 713 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 SPHK1Q9NYA1 384 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 A8MUA0 341 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 OR6M1Q8NGM8 313 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 ISL2Q96A47 359 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 GPR18Q14330 331 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 ZNF251Q9BRH9 671 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 TGIF2Q9GZN2 237 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 C7orf72A4D263 438 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 ITGB2P05107 769 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 SFTPDP35247 375 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 TGFBR3Q03167 851 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 FCRLAQ7L513 359 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 GABARAPL3Q9BY60 117 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 PLSCR1O15162 318 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 SMIM18P0DKX4 95 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 CPN1P15169 458 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 FABP6P51161 128 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 OPN5Q6U736 354 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 OR1J2Q8NGS2 313 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 OR1J1Q8NGS3 322 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 STRADBQ9C0K7 418 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 FANCMQ8IYD8 2048 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 I6L893 689 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 CPEP16870 476 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 F2RL3Q96RI0 385 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 KCNK6Q9Y257 313 aa15.79■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 TRABD2BA6NFA1 517 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 RABGGTBP53611 331 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 CAMK2BQ13554 666 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 ZNF680Q8NEM1 530 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 OR5M8Q8NGP6 311 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 SFXN2Q96NB2 322 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 CCL23P55773 120 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 LCN6P62502 163 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 NSDHLQ15738 373 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 STK11Q15831 433 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 KCNJ15Q99712 375 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 ZNF620Q6ZNG0 422 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 SYT13Q7L8C5 426 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 IRF7Q92985 503 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 PATJQ8NI35 1801 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 STEAP1BQ6NZ63 245 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 GPR34Q9UPC5 381 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 FPR3P25089 353 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 SOX18P35713 384 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 RPS25P62851 125 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 RAET1LQ5VY80 246 aa15.78■□□□□ 0.12
HCN1-201ENST00000303230 SCLYQ96I15 445 aa15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.4 ms