RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 H7C1Q1 480 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CLIC1O00299 241 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 PPP1R2P9O14990 202 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 LRRTM2O43300 516 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 IFNGR1P15260 489 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 GMPRP36959 345 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 FABP6P51161 128 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 NXPH1P58417 271 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 STARD6P59095 220 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CEACAM7Q14002 265 aa7.26□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 TMEM233B4DJY2 109 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 TYROBPO43914 113 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 STSP08842 583 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 HTR1AP08908 422 aa7.26□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 OR1C1Q15619 314 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 GPR157Q5UAW9 335 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 BPIFB2Q8N4F0 458 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 OR5AR1Q8NGP9 310 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 MCHR1Q99705 422 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 COPS3Q9UNS2 423 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ICKQ9UPZ9 632 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ZNF175Q9Y473 711 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 H0YGG7 62 aa7.26□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 TAS2R38P59533 333 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 GPR18Q14330 331 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ZSWIM9Q86XI8 627 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ZNF382Q96SR6 550 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 NIPAL2Q9H841 368 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CBLCQ9ULV8 474 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.26□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 TARM1B6A8C7 271 aa7.26□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 GP1BAP07359 652 aa7.26□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 ZNF584Q8IVC4 421 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 OR2A12Q8NGT7 310 aa7.26□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 RAB1CQ92928 201 aa7.26□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 SARDHQ9UL12 918 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CITO14578 2027 aa7.26□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 A0A087WZY1 265 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SLC22A5O76082 557 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SOX14O95416 240 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 OPN1SWP03999 348 aa7.25□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 G0S2P27469 103 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 VEGFCP49767 419 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ATP4BP51164 291 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 EMP3P54852 163 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 NDUFA6P56556 154 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 UGT3A2Q3SY77 523 aa7.25□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.25□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 LOC730098B7Z3J9 87 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 DIRAS3O95661 229 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 RNF212Q495C1 297 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ALKAL2Q6UX46 152 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 LACC1Q8IV20 430 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 MORN4Q8NDC4 146 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 OR5T1Q8NG75 326 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SLC37A2Q8TED4 501 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 RTP4Q96DX8 246 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 TMEM43Q9BTV4 400 aa7.25□□□□□ -1.25
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