RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa12.31□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 MPDZO75970 2070 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 PCP4L1A6NKN8 68 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 OR7A10O76100 309 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 APBB3O95704 486 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ADH1BP00325 375 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 GRK6P43250 576 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 LGALS3BPQ08380 585 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 BEX5Q5H9J7 111 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 TCTE1Q5JU00 501 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM240Q5SV17 173 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SIGIRRQ6IA17 410 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF425Q6IV72 752 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 TRILQ7L0X0 811 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 DPY19L4Q7Z388 723 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 RCBTB1Q8NDN9 531 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 OR10AC1Q8NH08 325 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SLC22A7Q9Y694 548 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 RAF1P04049 648 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 COL9A1P20849 921 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 BTCP35070 178 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 PTH2RP49190 550 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 GUCA2AQ02747 115 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 HSF2Q03933 536 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 BTN1A1Q13410 526 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 C4orf46Q504U0 113 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 Q6ZSR6 202 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF627Q7L945 461 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 FAM220AQ7Z4H9 259 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 NSMAFQ92636 917 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SLC22A18Q96BI1 424 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SOSTQ9BQB4 213 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 MCCC2Q9HCC0 563 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SATB2Q9UPW6 733 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 KIAA1671Q9BY89 1806 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 CARNS1A5YM72 827 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 PLPP2O43688 288 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ZFPL1O95159 310 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 UBL3O95164 117 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 FAM157BP0CG42 384 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 CFL1P23528 166 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 PBX2P40425 430 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 FOXL2P58012 376 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 PLA2G7Q13093 441 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 BIKQ13323 160 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 OR51Q1Q8NH59 317 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 WDR92Q96MX6 357 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 GDF15Q99988 308 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SLITRK2Q9H156 845 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ZFP64Q9NPA5 681 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 IFNA7P01567 189 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 IGKV1D-16P01601 117 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 TNK1Q13470 666 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 GSG1Q2KHT4 349 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 PCGF3Q3KNV8 242 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 GARNL3Q5VVW2 1013 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 NLRC3Q7RTR2 1065 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 PGLYRP3Q96LB9 341 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF350Q9GZX5 532 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ARL6Q9H0F7 186 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 GHITMQ9H3K2 345 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 UBQLN2Q9UHD9 624 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 HEATR5AQ86XA9 2040 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 TRAV18A0A075B6X5 111 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF879B4DU55 563 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 OR6A2O95222 327 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SERPINA3P01011 423 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 OPN1LWP04000 364 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ST6GAL1P15907 406 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 PRKACBP22694 351 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 MAZP56270 477 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 TAS2R43P59537 309 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 MELKQ14680 651 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 FCRL6Q6DN72 434 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 FAM198BQ6UWH4 519 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 OR51D1Q8NGF3 324 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 OR51A4Q8NGJ6 313 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 MYADMQ96S97 322 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 HRASLSQ9HDD0 168 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 C2orf42Q9NWW7 574 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD1-201ENST00000259365 FBXL3Q9UKT7 428 aa12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms