RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 RBBP4Q09028 425 aa19.15■□□□□ 0.66
NME4-201ENST00000219479 ALG10BQ5I7T1 473 aa19.15■□□□□ 0.66
NME4-201ENST00000219479 TSPO2Q5TGU0 170 aa19.15■□□□□ 0.66
NME4-201ENST00000219479 ADAM5Q6NVV9 412 aa19.15■□□□□ 0.66
NME4-201ENST00000219479 KLHL17Q6TDP4 642 aa19.15■□□□□ 0.66
NME4-201ENST00000219479 C5orf46Q6UWT4 87 aa19.15■□□□□ 0.66
NME4-201ENST00000219479 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
NME4-201ENST00000219479 RETREG3Q86VR2 466 aa19.15■□□□□ 0.66
NME4-201ENST00000219479 LSMEM1Q8N8F7 131 aa19.15■□□□□ 0.66
NME4-201ENST00000219479 POMGNT2Q8NAT1 580 aa19.15■□□□□ 0.66
NME4-201ENST00000219479 MFSD8Q8NHS3 518 aa19.15■□□□□ 0.66
NME4-201ENST00000219479 PIF1Q9H611 641 aa19.15■□□□□ 0.66
NME4-201ENST00000219479 C12orf10Q9HB07 376 aa19.15■□□□□ 0.66
NME4-201ENST00000219479 TMEM27Q9HBJ8 222 aa19.15■□□□□ 0.66
NME4-201ENST00000219479 SLC7A10Q9NS82 523 aa19.15■□□□□ 0.66
NME4-201ENST00000219479 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa19.15■□□□□ 0.66
NME4-201ENST00000219479 DPRXA6NFQ7 191 aa19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 INAFM1C9JVW0 142 aa19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 OR2T1O43869 369 aa19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 TMCC2O75069 709 aa19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 HTR2AP28223 471 aa19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 ARFIP2P53365 341 aa19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 IL1RL1Q01638 556 aa19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 ULK3Q6PHR2 472 aa19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 TMEM108Q6UXF1 575 aa19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 KBTBD8Q8NFY9 601 aa19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 SLC38A4Q969I6 547 aa19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 SLC47A1Q96FL8 570 aa19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 GSX2Q9BZM3 304 aa19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 EVA1AQ9H8M9 152 aa19.14■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 A0A1W2PR80 420 aa19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 ITGA5P08648 1049 aa19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 PTH2RP49190 550 aa19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 ZNF83P51522 516 aa19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP19.13■□□□□ 0.651e-6■■■■□ 23.8
NME4-201ENST00000219479 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 SELPLGQ14242 412 aa19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 GABRA6Q16445 453 aa19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 MMEL1Q495T6 779 aa19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 FAM91A1Q658Y4 838 aa19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 KLHL24Q6TFL4 600 aa19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 C6orf89Q6UWU4 347 aa19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 COMTD1Q86VU5 262 aa19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 SLC30A8Q8IWU4 369 aa19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 SMYD1Q8NB12 490 aa19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 ZNF446Q9NWS9 450 aa19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 SONP18583 2426 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 PRR14LQ5THK1 2151 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 ABCD4O14678 606 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 MPGP29372 298 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 CDH11P55287 796 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 EGR4Q05215 589 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 DMTNQ08495 405 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 FAM69AQ5T7M9 428 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 PTOV1Q86YD1 416 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 C17orf78Q8N4C9 275 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 ZIC4Q8N9L1 334 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 SLC26A7Q8TE54 656 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 RADILQ96JH8 1075 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 MUS81Q96NY9 551 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 EPYCQ99645 322 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 PTDSS2Q9BVG9 487 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 PRR14Q9BWN1 585 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 FAIMQ9NVQ4 179 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 NPAP1Q9NZP6 1156 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 POU2F3Q9UKI9 436 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 MGAT4BQ9UQ53 548 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 SLC25A15Q9Y619 301 aa19.12■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa19.11■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 OR6C65A6NJZ3 312 aa19.11■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 ZNF587BE7ETH6 402 aa19.11■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 M0R1B8 84 aa19.11■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 AIM2O14862 343 aa19.11■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 MFN2O95140 757 aa19.11■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 OPN1SWP03999 348 aa19.11■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 ZNF43P17038 809 aa19.11■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 PTAFRP25105 342 aa19.11■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 P2RY4P51582 365 aa19.11■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 ATP5J2P56134 94 aa19.11■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 PPP2R2BQ00005 443 aa19.11■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 C1DQ13901 141 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 MAPRE2Q15555 327 aa19.11■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 OR1Q1Q15612 314 aa19.11■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
NME4-201ENST00000219479 NIPAL3Q6P499 406 aa19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms