RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	PRG2	P13727	222 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SELENOP	P49908	381 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	PDLIM4	P50479	330 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	EPS8	Q12929	822 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SMU1	Q2TAY7	513 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	NIPAL3	Q6P499	406 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	LINGO2	Q7L985	606 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	PROX1	Q92786	737 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	TESC	Q96BS2	214 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	OR52E6	Q96RD3	313 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SOX7	Q9BT81	388 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ADAM19	Q9H013	955 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CENPH	Q9H3R5	247 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	LRP5L	A4QPB2	252 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	UPK3A	O75631	287 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	WNT11	O96014	354 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	GPI	P06744	558 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	GUSB	P08236	651 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SRD5A1	P18405	259 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	NR4A2	P43354	598 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	HOXC5	Q00444	222 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	STX3	Q13277	289 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	MPP2	Q14168	576 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	MAPK11	Q15759	364 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	KRT71	Q3SY84	523 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ATG16L1	Q676U5	607 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC115	Q96NT0	180 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	AQP7P3	A6NL99	342 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	VWC2L	B2RUY7	222 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	TGFA	P01135	160 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CELA3B	P08861	270 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	KIT	P10721	976 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ETFA	P13804	333 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CALCR	P30988	508 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SERPINF1	P36955	418 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	GZMK	P49863	264 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	FAM166A	Q6J272	317 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CMIP	Q8IY22	773 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM45B	Q96B21	275 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	ZIM3	Q96PE6	472 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CA10	Q9NS85	328 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	SDHD	O14521	159 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	FRS3	O43559	492 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	BCHE	P06276	602 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	PGR	P06401	933 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CSF3	P09919	207 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	OR4A8	P0C604	315 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TCF4-262	ENST00000628078	CBL	P22681	906 aa		11.74	□□□□□ -0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112 ms